Иако обојица представљају алтернативне лекове, чудно је како верници ове две медицинске науке никада нису упоређивали један са другим, већ увек са алопатским лековима.
Ајурведски су у југоисточној Азији у пракси за јоне, док хомеопатија постоји у пракси већ три века. Обоје следе различиту филозофију у излечењу болести. Док ајурведски лек допуњује научне алопатске лекове, хомеопатија је против. Верници ајурведских лекова тврде да природност не може наштетити ниједном.
Аиурведа верује у спречавање болести, док се хомеопатија заснива на лечењу болести. Јога, део ајурведске форме медицине, користи се широм света као облик лечења и широко је прихваћена у научној заједници. У ајурведској медицини биљке и масаже користе се у невољи и сматрају се природнијима.
У Ајурведи се верује да човек може остати без било које болести задржавањем токсина из свог тела. Такође користи оралне лекове направљене од биља и зачина, као и хируршке процедуре за испирање токсина из тела; на тај начин излечи болести и разне тегобе. У хомеопатији се болести лече увођењем симптома сличних онима болести у много разређеном облику. Вјерује се да ће ово помоћи животној снази да неутралише болест и тако излијечи пацијента.
Према филозофији хомеопатије, болести се не контактирају, али су увек присутне код нас. Вештаци хомеопатије верују да су ови поремећаји у животној снази главни разлози за болести и да их треба исправити за излечење болести.
Иако и Ајурведа и Хомеопатија верују у важност позитивног ума, они се у својим облицима лечења увелико разликују. Хомеопатија је одувек била критична према алопатским лековима и верује да болести лечене алопатским лековима никада не напуштају организам у потпуности, већ их само потискују и болести ће се вратити када ефекат ових лекова нестане.
Ваљаност ових лекова увек би била оспоравана, а да ниједна страна не попушта другој.