Тхе кључна разлика Између алфа и бета хеликса, зависи од врсте везања водоника који настају у развоју ових структура. Алфа хеликули формирају интра-молекуларне водоничне везе, док бета-хеликуле формирају међу-молекуларне водоничне везе.
Сложени протеини имају четири структурална организациона нивоа - примарни, секундарни, терцијарни и квартерни. Секундарне структуре протеина творе ланце пептида у различитим оријентацијама. Пептидни ланци се састоје од аминокиселинских секвенци везаних пептидним везама. Стога постоје две главне секундарне структуре протеина као алфа хеликса и бета хеликс. Поред тога, постоје и друге секундарне структуре које се називају бета турн и хаирпин структуре. Углавном се овај чланак фокусира на разлику између алфа и бета хелика.
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је Алпха Хелик
3. Шта је Бета Хелик
4. Сличности између Алпха и Бета Хелик-а
5. Упоредно упоређивање - Алпха вс Бета Хелик у табеларном облику
6. Резиме
Протеини имају четири структурна нивоа организације. Од њих је алфа хеликс најчешћа секундарна структура протеина. А ова се структура појављује као штап који је намотан око централне осе. Поред тога, алфа хелик је десна хелик. Међутим, могу бити присутни и левичарски хеликоптери. Овде се пептидне везе формирају од амино-терминала до карбокси-терминала. Аминокиселине се међусобно повезују путем ових пептидних веза. Интра-молекуларне водоничне везе су главни узрок стварања алфа-хеликса.
Слика 01: Алпха Хелик
Распоред алфа хеликса зависи од хидрофилне и хидрофобне природе протеина. Ако се аминокиселинска секвенца састоји од великог броја хидрофилних Р (променљивих) група, Р групе се оријентишу на водену фазу. Ако су променљиве групе хидрофобне, излазиће на хидрофобну фазу окружења. У оба сценарија чини се да се Р групе шире изван спиралне структуре. Због ових структурних карактеристика, алфа хелик је отпорнији на мутације. Према томе, присуство водоничних веза стабилизира структуру алфа хеликса. Просечно је 3,6 остатака по окретају у алфа спирали јер је потребно 3,6 остатака да би се развиле водоничне везе. Неки структурни протеини попут колагена и кератина богати су алфа хеликалима.
Бета хеликс је друга најчешћа секундарна структура протеина. Иако није тако уобичајена као алфа хеликса, присуство бета хелика такође игра велику улогу у структури протеина. Формирање бета хелика одвија се кроз два бета листа распоређена или паралелно или анти паралелно. Ови листови се тада формирају у спиралну структуру. Међ молекуларне водоничне везе између два ланца плоче помажу у стварању бета хеликса.
Слика 02: Бета Хелик
Бета хеликоптери могу бити и десни или левичар, у зависности од дезена везања. Приликом формирања бета хелика, променљиве групе две бета листе ће се сместити унутар језгре хелика. Због тога, већина група које формирају бета листове има хидрофобне функције.
За разлику од алфа хелика, 17 остатака чине један заокрет у Бета хелицама. Јони метала имају способност активирања формирања Бета хелика. Слично алфа спирали, водоничне везе подржавају одржавање структуре Бета хелика. Ензим карбонска анхидраза и пектатна лиза су два протеина богата бета хеликалима.
Кључна разлика између алфа и бета спирале је врста водоничне везе коју показују. Алпха хелик показује интра-молекуларно везивање водоника док бета хелик показује међу-молекуларно везивање водоника. Поред тога, алфа хеликса формира десни хелик, док бета хелик може формирати и десне и леве хеликоптере. Дакле, ово је такође значајна разлика између алфа и бета хелика.
Штавише, даљња разлика између алфа и бета хеликса је у томе што се формирање алфа хеликса одвија увртањем аминокиселинске секвенце, док се у формирању бета хеликса два бета листа или паралелно или анти-паралелно везују да формирају спиралну структуру..
Ниже инфо-графика представља више информација о разлици између алфа и бета хелика.
И алфа и хеликоптери су важни у препознавању и утврђивању сложених протеинских структура. Обе врсте су секундарне структуре протеина. Међутим, алфа хелик је спирални облик секвенци аминокиселина. Супротно томе, формирање бета хелика одвија се везањем водоника паралелних или анти-паралелних бета листова. Даље, водоникова веза је интра-молекуларна у алфа-спиралном облику, док је водоничка веза међу-молекуларна у бета-спиралном облику. Поред тога, обе ове структуре имају Р групу, која одређује хидрофобност протеина. Дакле, ово сумира разлику између алфа и бета хелика.
1. "Налози протеинске структуре." Кхан Ацадеми, Кхан Ацадеми, доступно овде.
2. "Секундарна структура протеина: α-Хелицес и β-Схеетс." Структурна биоинформатика: Практични водич, доступан овде.
1. “Алпха бета струцтуре (2)” Аутор: Схафее - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 4.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. "1м8н Цхористонеура фумиферана" аутор ВилловВ на Википедији на енглеском језику (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа