Разлика између тупе и лепљиве завршне везе

Кључна разлика - Блунт вс Стицки Енд Лигатион
 

Рестриктивни ендонуклези су специфични ензими који режу дволанчане ДНК (дсДНА). Такође су познате и као молекуларне маказе у молекуларној биологији. Рестриктивни ензими могу да препознају специфичне кратке секвенце дсДНА познате као места препознавања и цепају фосфодиестерске и водоничне везе да би отворили двоструке ланце. Као резултат цепања ових ензима, настају фрагменти ДНК са различитим врстама крајева, попут лепљивих крајева и тупих крајева. ДНК лигаза је ензим који се користи у молекуларној биологији да споји два суседна ланца ДНК формирањем нових веза. Корак је познат као лигација и према врсти ДНК краја лигираног, може се назвати глупим и лепљивим крајњим лигацијама. Кључна разлика између тупе и лепљиве завршне везиве је та везивање тупим крајем настаје између фрагмената ДНК који садрже два тупа краја док лепљива крајња лигација настаје између 5 'и 3' преклопа. У поређењу са тупом завршном лигацијом, лепљива крајња лигација је ефикаснија и стабилнија.

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је Блунт Енд Лигатион
3. Шта је лепљива завршна веза
4. Упоредна успоредба - Блунт вс Стицки Енд Лигатион
5. Резиме

Шта је тупа крајња веза?

Неке рестрикцијске ендонуклеазе могу пресећи ДНК на супротним базама и створити фрагменте тупим крајем ДНК. Ови ензими познати су под називом секачи за тупи крај; они се одвајају равно до средине места забране без остављања једноструких висећих база. Тупи крајеви су такође познати као не-преклопиви крајеви, јер на крајевима немају 3 'и 5' превисне базе. Оба прамена завршавају од базних парова тупим крајевима. Уобичајени ензими резања су: ЕцоРВ ХаеИИИ, АлуИ и СмаИ.

Тупо везивање је укључено између два тупа краја. То није везање избочених база. Ова лигација је мање ефикасна од лепљиве крајње лигације. Међутим, у неким приликама, тупа завршна лигација постаје повољнија од лепљиве крајње лигације, посебно када се лигарају ПЦР производи. ПЦР производи се увек производе са тупим крајевима. Тупом крајњом лигацијом нису потребни комплементарни крајеви у ДНК за лигацију.

Слика 01: Крајња продукција ензимом Ецо РВ

Шта је лепљива завршна веза?

Неке рестрикцијске ендонуклеазе могу смањити дсДНА, остављајући на крају вишак комада једноланчане ДНК. Ови крајеви су познати као лепљиви или висећи крајеви. Лепљива крајња лигација се дешава између два фрагмента ДНК који садрже одговарајуће преграде, јер су лепљиви крајеви поседовани са парним базама и захтевају се комплементарне базе да би се формирале везе. Стога је неопходно користити исти рестрикцијски ензим за оба извора ДНК да би се произвели одговарајући фрагменти лигације.

Лепљива крајња лигација је ефикаснија и често је пожељна у процесима клонирања. Постоји неколико рестрикцијских ензима који дају лепљиве крајеве. То су ЕцоРИ, БамХИ, ХиндИИИ итд.

Слика 02: Лепљива крајња производња ензимом Ецо РИ

Која је разлика између Блунт и Стицки Енд Лигатион-а?

Блунт вс Стицки Енд Лигатион
Лупљива крајња лигација се дешава између два фрагмента ДНК тупог краја.	Лепљива крајња лигација настаје између два подударајућа фрагмента ДНК са лепљивим крајевима.
Ензими
Тупи резачи производе тупи крајеви.	Лепљиви крајњи резачи стварају лепљиве или кохезивне крајеве.
Захтеви подударања завршава
Не захтева подударање фрагмената или комплементарних база.	Потребне су комплементарне базе на крајевима да би се формирали парови база.
Ефикасност
Мање је ефикасна од лепљиве завршне везиве	То је ефикасније од тупих лигација.

Преглед - Блунт вс Стицки Енд Лигатион

Рестриктивне ендонуклезе могу цепати дсДНА и стварати фрагменте ДНК са различитим крајевима. Препознају специфичне секвенце и ограничавају ДНК стварајући лепљиве и тупе крајеве. Лепљиви крајеви имају неспарене основе на крају фрагмената. Тупи крајеви се стварају услед равног деколтеа и на крајевима имају базне парове. Лепљива крајња лигација захтева два комплементарна једноланчана ДНК дела. Тупа крајња лигација настаје између било која два фрагмента тупих крајева. Ово је разлика између тупих и лепљивих лигација.

Референце:
1. Робертс, Рицхард Ј. "Како су рестрикциони ензими постали радни коњи молекуларне биологије." Зборник радова Националне академије наука. Натионал Ацад Сциенцес, н.д. Веб. 12 апр 2017
2. Аднан, Амна. Употреба рестрикцијских ензима у биотехнологији. Н.п., н.д. Веб. 12 апр 2017

Љубазношћу слике:
1. „ЕцоРВ Рестрицтион Сите.рсх“ Рамин Херати - Направљено помоћу Инксцапе-а (Публиц Домаин) преко Цоммонс Викимедиа
2. "Рестриктивни ензим Ецо РИ" Аутор Тинастелла - Властити рад (Публиц Домаин) преко Цоммонс Викимедиа