Разлика између цДНА и Геномиц Либрари

Кључна разлика - цДНА вс Геномиц Либрари
 

Постоје две главне врсте библиотека ДНК које су научници конструисали техникама генетског инжењеринга. То су цДНА библиотека и Геномиц либрари. Тхе кључна разлика између цДНА и геномске библиотеке је то цДНА библиотека садржи клонирану комплементарну ДНК укупне мРНА организма док библиотека геномске ДНК садржи клониране фрагменте целокупног генома организма. Библиотека геномске ДНК већа је од библиотеке цДНА.

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је библиотека цДНА
3. Шта је Геномска библиотека
4. Упоредна упоредба - цДНА вс Геномиц Либрари
5. Резиме

Шта је геномска библиотека?

Библиотека геномске ДНК је збирка клонова који носе фрагменте укупне геномске ДНК организма. Садржи целу геномску ДНК тог организма, укључујући кодирајуће и некодирајуће секвенце. Изградња геномске библиотеке врши се рекомбинантном ДНК технологијом, праћено клонирањем (генетичким инжењерингом). Постоје различити кораци у изградњи као што је приказано на слици 01. Процес започиње изолацијом геномске ДНК. Употребом одговарајућег протокола екстракције ДНК, треба изоловати укупну геномску ДНК организма. Тада би ДНК требало да се претвори у обрадиве величине или у специфичне фрагменте рестрикцијским ендонуклеазама (ензими за резање ДНК). Фрагментирана ДНК треба да се убаци у векторе помоћу ДН лигаза (ензима који спајају ДНК). Вектор је организам који се само понавља. Плазмиди и бактериофаги су најчешће коришћени вектори у рекомбинантној ДНК технологији. Ови везани вектори познати су као рекомбинантни молекули ДНК, јер носе и сопствене и уметнуте ДНК секвенце. Рекомбинантни вектори се додају у бактерију домаћина и праве се да прихвате рекомбинантне векторе унутар бактеријске ћелије. Бактерије са рекомбинантним векторима (плазмиди) треба да се гаје у медијуму за културу. Током бактеријског умножавања, бактеријска ДНК заједно са рекомбинантним плазмидима реплицира њихове геноме и ствара клонове. Ови клонови садрже цео геном изворног организма. Отуда се назива геномска библиотека. Плазмиди се могу лако одвојити од бактеријске хромозомске ДНК да би конструисали геномску библиотеку тог организма. Ако одређени организам садржи заинтересоване гене, лако га је открити у геномској библиотеци хибридизацијом помоћу молекуларних сонди (маркера).

Геномске библиотеке су важне за проучавање структуре и функције генома, специфичних гена, локације гена, мапирања гена, мутација, секвенцирања гена, идентификације нових терапијских гена итд..

Слика_1: Изградња геномске библиотеке

Шта је библиотека цДНА?

Библиотека цДНА је збирка комплементарних клонова ДНК (цДНА) који се синтетишу из укупне мРНА организма. Поступак изградње укључује различите кораке. Прочишћавање укупне мРНА из организма је први корак који укључује. Изолована мРНА се претвара у цДНА ланце помоћу процеса названог реверзна транскрипција. Обрнута транскрипција је олакшана ензимом званим реверзна транскриптаза. Користи мали 3 'прајмер и покреће синтезу првог ланца цДНА комплементарног ланца мРНА. Резултирајућа дволанчана цДНА се претвара у мање фрагменте помоћу рестрикцијских ендонуклеаза и убацује се у погодне векторе. Ови конструисани рекомбинантни молекули се затим додају у организам домаћина и узгајају у медијуму за производњу да би се произвели клонови. Колекција клонова која садржи фрагменте цДНА организма позната је као библиотека цДНА. Потпуно нарезана зрела мРНА не садржи интроне и регулаторне регионе. Према томе, некодирајући фрагменти нису присутни у библиотекама цДНА за разлику од геномске библиотеке.

цДНА библиотеке су важне за анализу подручја кодирања, функција гена, експресије гена итд.

Слика_2: Изградња цДНА библиотеке

Која је разлика између цДНА и Геномиц Либрари?

цДНА вс Геномиц Либрари
цДНА библиотека је збирка клонова који носе комплементарну ДНК у мРНА организма	Геномска библиотека је збирка клонова који носе укупну геномску ДНК у организму.
Кодирање у односу на некодирајуће секвенце
цДНА библиотека садржи само кодирајуће секвенце; не садржи интроне.	Геномска библиотека састоји се од целокупне геномске ДНК, укључујући некодирајућу (интронсну и регулаторну) ДНК.
Величина
цДНА библиотека је мала.	Геномска библиотека је велика.
Почетни материјал
Полазни материјал је мРНА	Полазни материјал је ДНК.
Укључивање обрнуте транскрипције.
Обрнута транскрипција се дешава при првој синтези цДНА ланца.	Обрнута транскрипција се не дешава.

Резиме - цДНА и Геномиц Либрари

Геномска библиотека представља популацију клонова који носе фрагментирану укупну геномску ДНК организма. цДНА библиотека представља популацију клонова који садрже комплементарну ДНК укупне мРНА организма. Клон цДНА садржи само секвенце које се налазе у мРНА док геномски клон садржи секвенце целог генома. Ово је разлика између цДНА и геномске библиотеке.

Референце:
1. Ханееф, Деена Т КоцхунниЈазир. "Разлика између библиотеке Геномиц и цДНА." Разлика између библиотеке Геномиц и цДНА. Н.п., н.д. Веб. 15. фебруар 2017
2. Стекел, Дов Ј., Иоав Гит и Францесцо Фалциани. „Поређење експресије гена из више библиотека цДНА“. Истраживање генома. Цолд Спринг Харбор Лаборатори Пресс, децембар 2000. Веб. 16 фебруар 2017
3. "Геномски библиографски екрани за гене који су укључени у н-бутанол толеранцију у Есцхерицхиа цоли." Заслони геномске библиотеке за гене који су укључени у н-бутанол толеранцију у Есцхерицхиа цоли. Н.п., н.д. Веб. 16 фебруар 2017

Љубазношћу слике:
1. “Формирање цДНА библиотеке” др Дре на енглеском језику Википедиа (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. „Изградња геномске библиотеке“ Алукуетте - Властити рад (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа