Разлика између хромосомског ходања и скакања

Кључна разлика - Хромосомска шетња вс скакање
 

Хромосомско ходање и скакање хромозома два су техничка средства која се користе у молекуларној биологији за лоцирање гена на хромозомима и физичко мапирање генома. Хромосомско ходање је техника која се користи за клонирање циљног гена у геномској библиотеци поновљеним изолирањем и клонирањем суседних клонова геномске библиотеке.. Хромосомско скакање је посебна верзија хромосомског ходања која превазилази тачке хромосомског ходања. Хромосомско ходање може само секвенцирати и мапирати мале дужине хромозома, док хромосомско скакање омогућава секвенцирање великих делова хромозома. Ово је кључна разлика између хромосомског ходања и хромосомског скакања.

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је хромосомна шетња
3. Шта је хромосом скок
4. Упоредна упоредба - Хромосомска шетња вс скакање
5. Резиме

Шта је хромосомска шетња?

Хромосомско ходање је алат који истражује подручја непознатих секвенци хромозома помоћу преклапајућих рестрикцијских фрагмената. У хромозому хода, део познатог гена користи се као сонда и наставља се са карактеризацијом целе дужине хромозома који се пресликава или секвенционира. Ово иде од маркера до циљане дужине. Код хромозомског хода, крајеви сваког преклапајућег фрагмента користе се за хибридизацију за идентификацију следеће секвенце.

Сонде су припремљене од крајњих делова клониране ДНК и субклониране су. Затим се користе за проналажење следећег фрагмента који се преклапа. Све ове секвенце која се преклапају користе се за изградњу генетске мапе хромозома и лоцирање циљних гена. То је метода за анализу дугих протеза ДНК малим фрагментима који се преклапају из обновљене геномске библиотеке.

Хромосомска техника хода - кораци

1. Изолација ДНК фрагмента који садржи познати ген или маркер у близини циљног гена

2. Припрема мапе рестрикције изабраног фрагмента и субклонирање крајњег дела фрагмента за коришћење као сонда
3. Хибридизација сонде са наредним фрагментом који се преклапа
4. Припрема мапе рестрикције фрагмента 1 и субклонирање крајњег дела фрагмента 1 за сонду за идентификацију следећег преклапајућег фрагмента.
5. Хибридизација сонде са следећим преклапајућим фрагментом 2

6. Израда рестрикцијске карте фрагмента 2 и субклонирање крајњег дела фрагмента 2 која служи као сонда за идентификацију следећег преклапајућег фрагмента

Горњи кораци се требају наставити до циљаног гена или до 3 'краја укупне дужине секвенце.

Слика 01: Техника ходања хромосомима

Хромосомско ходање је важан аспект цитогенетике у проналажењу СНП-а многих организама и анализирању генетски преносивих болести и проналажењу мутација релевантних гена.

Шта је хромосом скок?

Хромосомско скакање је техника која се користи у молекуларној биологији за физичко мапирање генома организма. Ова техника је уведена да би се превазишла баријера хромозомског хода која је настала проналаском понављајућих ДНК подручја током процеса клонирања. Стога се техника скакања хромозома може сматрати посебном верзијом хромосомског ходања. То је брза метода у поређењу са хромозомским ходањем и омогућава заобићи понављајуће секвенце ДНК за које није склона да се клонирају током хромосомског ходања. Хромосомско скакање сужава јаз између циљаног гена и доступних познатих маркера за мапирање генома.

Алат за скакање хромосома започиње сечењем специфичне ДНК са посебним рестрикцијским ендонуклеазама и лигацијом фрагмената у циркулизоване петље. Затим се прајмер дизајниран из познате секвенце користи за секвенцирање циркулизованих петљи. Овај прајмер омогућава скакање и секвенцирање на алтернативни начин. Дакле, он може заобићи понављајуће секвенце ДНК и брзо ходати кроз хромосом у потрази за циљаним геном.

Откривање гена који кодира за болест цистичне фиброзе урађено је помоћу алата за скакање хромозома. У комбинацији, хромозомско скакање и ходање могу побољшати процес мапирања генома.

Слика 02: Хромосомски скокови

Која је разлика између хромосомског ходања и скакања?

Хромосомска шетња вс скакање
Хромосом је алат који се користи у молекуларној биологији за мапирање генома и лоцирање специфичних гена.	Хромосомско скакање је алат који се користи за физичко мапирање генома и брзо проналажење циљних гена у хромозомима.
Упоредне дужине секвенцирања
Само мали фрагменти могу се клонирати хромозомским ходањем.	Веће дужине хромозома могу се пресликати кромосомским скакањем.
Клонирање понављајуће ДНК у хромосомима
Хромосомска техника хода има потешкоће у ходању кроз понављајуће секвенце ДНК које се налазе у хромосомима.	Омогућује заобићи понављајуће секвенце ДНК. Стога нема потешкоћа када их пронађете током секвенцирања.
Чимбеници који утичу на процесе
Успех процеса зависи од величине генома и удаљености коју мора прећи од познатог геномског положаја ка жељеном гену.	Успех не зависи од величине генома удаљености од маркера до циља.
Ефекти неклониране ДНК
Хромосомско ходање може се зауставити неклонираним фрагментима ДНК.	Пиколоти са најмањом нотом могу да играју Д4.
Потреба за познатим редоследом
Процес започиње познатим геном у близини циља.	За поступак је потребан познати фрагмент за обликовање прајмера.

Преглед - Хромосомска шетња вс скакање

Хромосомско ходање се често примењује када се зна да се одређени ген налази у близини претходно клонираног гена у хромозому и да га је могуће идентификовати понављаном изолацијом суседних генских клонова из геномске библиотеке. Међутим, када се пронађу понављајуће ДНК регије током технике хромосомског ходања, поступак се не може наставити. Због тога се техника прекида од те тачке. Хромосомско скакање је молекуларно биолошко средство које превазилази ово ограничење за мапирање генома. Заобилази ове понављајуће ДНК регије које је тешко клонирати и помаже у физичком пресликавању генома. Ово је главна разлика између хромозомског ходања и скакања.

Референце:
1. Накасеко, Иукинобу, Иасухиса Адацхи, Схин-ицхи Фунахасхи, Осами Нива и Митсухиро Ианагида. "Хромосомско ходање показује високо хомологну понављајућу секвенцу која је присутна у свим центромеровим регионима дељеног квасца." ЕМБО Јоурнал. Америчка национална медицинска библиотека, мај 1986. Веб. 22. март 2017
2. Тахери, Али. "Хромосомски ходање и скакање." Напредак у генетском инжењерингу. ОМИЦС Интернатионал, 30. октобра 2013. Веб. 22. март 2017