Разлика између ФИСХ и ЦГХ

Тхе кључна разлика између ФИСХ и ЦГХ је то ФИСХ је молекуларна техника која детектује специфичну секвенцу ДНК на хромосому помоћу флуоресцентно обележених сонди, док је ЦГХ друга молекуларна цитогенетска техника која детектује промене геномске ДНК.

Цитогенетска анализа игра важну улогу у медицини приликом откривања кромосомских абнормалности као што су анеуплоидије, брисања, дупликације и преуређења, итд. Хромосомске неправилности на крају доводе до генетских болести попут рака, неплодности, Довн синдрома, Клинефелтеровог синдрома, Турнеровог синдрома, леукемије итд. Постоје разне молекуларне цитогенетичке методе за откривање горе наведених оштећења и болести. Међу њима су ФИСХ (флуоресцентна ин ситу хибридизација) и ЦГХ (упоредна геномска хибридизација) две снажне технике хибридизације. Међутим, обе методе имају предности и недостатке.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је РИБА 
3. Шта је ЦГХ
4. Сличности између ФИСХ и ЦГХ
5. Упоредна упоредба - РИБЕ против ЦГХ у табеларном облику
6. Резиме

Шта је РИБЕ?

ФИСХ је техника хибридизације нуклеинске киселине која се изводи на делу или делу ткива, у целом ткиву или ћелијама. То је метода заснована на сонди. Техника зависи од теорије комплементарног спајања базе Ватсон Црицк-а, што резултира или ДНК-ДНК хибридима или ДНК-РНА хибридима, који на тај начин могу открити мутиране гене или идентификовати гене који нас занимају. Даље, ова техника користи једноланчане ДНК секвенце, дволанчане ДНК секвенце, једноланчане РНК секвенце или синтетички олигонуклеотид припремљени користећи ницк превод као сонде које су комплементарне генским секвенцама од интереса. Поред тога, најважнија карактеристика ове технике је обележавање сонди флуоресцентним бојама. Тако се сонде везују за комплементарне делове хромозома и олакшавају откривање.

Штавише, ФИСХ је веома осетљива и специфична метода. Стога је уобичајена техника како у истраживању тако и у дијагностици хематолошких малигних обољења и солидних тумора. Али, ФИСХ показује ниску резолуцију. Такође захтева претходно познавање циљане неправилности да би се конструисале секвенце сонде.

Слика 01: РИБЕ

Постоји много примјена ФИСХ-а, углавном у молекуларној дијагностици заразних болести ради идентифицирања присутности патогена и потврђивања патогена молекуларном дијагностиком. Штавише, ФИСХ је уобичајена техника у областима развојне биологије, кариотипизације и филогенетске анализе и физичког мапирања хромозома.

Шта је ЦГХ?

Упоредна геномска хибридизација (ЦГХ) је друга молекуларна цитогенетска техника заснована на ДНК која може открити промене секвенци геномске ДНК. Метода је напредна метода која може да анализира модификације хромозома и гена како би се откриле промене или измене у секвенци геномске ДНК. Даље, ЦГХ захтева изолацију и фрагментацију ДНК из експерименталног узорка и референтног узорка. Затим би узорке требало обележити две различите флуоресцентне боје (обично црвену и зелену). Касније су оба узорка мешана и дозвољена им је конкурентна хибридизација. Последњи корак је анализа узорака за измене у ДНК, као што су умножавање гена, губитак гена, итд. Посебно, мери се разлике у броју копије ДНК између тест узорка и контролног узорка.

Слика 02: ЦГХ

Још једна верзија ЦГХ-а је доступна; то је напреднија метода од уобичајене ЦГХ. То је техника која се зове ЦГХ заснована на низу или аЦГХ. аЦГХ омогућава прецизну идентификацију брисања гена или секвенце у више хиљада секвенци у једном једином експерименту.

Које су сличности између ФИСХ и ЦГХ?

• ФИСХ и ЦГХ су две молекуларне технике.
• И ФИСХ и ЦГХ се ослањају на хибридизацију нуклеинских киселина.
• Такође, обе технике требају дизајниране сонде за откривање специфичних циљева ДНК.
• Користимо их за пренаталну и постнаталну дијагностику генетских болести.
• Даље, и ФИСХ и ЦГХ су веома моћан алат за проучавање генских промјена.
• За означавање сонди користе флуоресцентне боје.

Која је разлика између ФИСХ и ЦГХ?

РИБЕ је ин ситу поступак хибридизације који користи флуоресцентне сонде за детекцију специфичних низова ДНК, док је ЦГХ техника молекуларне хибридизације која детектује измене секвенци геномске ДНК. Дакле, ово је кључна разлика између РИБЕ и ЦГХ.

Штавише, ФИСХ захтева претходно познавање циљане неправилности да би се конструисале секвенце сонде, док ЦГХ не захтева претходно знање. Такође, додатна разлика између ФИСХ и ЦГХ је та што ФИСХ показује ограничену резолуцију, док аЦГХ показује високу резолуцију.

Подаци у наставку резимирају разлику између ФИСХ-а и ЦГХ-а.

Преглед - ФИСХ вс ЦГХ

ФИСХ и ЦГХ су две молекуларне цитогенетичке технике које олакшавају детекцију генских секвенци које су од интереса. ФИСХ олакшава детекцију специфичне секвенце ДНК на хромосому помоћу флуоресцентно обележених сонди, док ЦГХ олакшава детекцију промјена у геномској ДНК. Дакле, ово је кључна разлика између РИБЕ и ЦГХ.

Референце:

1. „Флуоресценција у хибридизацији сита (ФИСХ)“ Новости о природи, издавачка група „Натуре“, доступна овде.
2. Хестер, Сусан Д и др. "Поређење технологија компаративне геномске хибридизације на Мицроарраи платформама." Часопис за биомолекуларне технике: ЈБТ, Удружење ресурса за биомолекуларне ресурсе, април 2009, доступно овде.

Љубазношћу слике:

1. „Мултиплек ВиевРНА тест РИБЕ у ћелијама Јуркат и ХеЛа“ Аутор: Риан Јеффс - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. „ЦГХ схема“ Мбаудис (разговор) (уплоад) - сопствени рад (ЦЦ БИ 2.5) преко Цоммонс Викимедиа