Гел електрофореза је техника која одваја макромолекуле у електричном пољу. У молекуларној биологији је уобичајена метода за одвајање ДНК, РНК и протеина од смеша према њиховој молекуларној величини. СДС Паге је врста гел електрофорезе која се користи за одвајање протеина од протеинске смеше на основу њихових величина. Гел електрофореза је термин који се користи за означавање уобичајене технике која се примењује за одвајање ДНК, РНА и протеина док СДС Паге је једна врста гел електрофорезе. Ово је кључна разлика између гел електрофорезе и СДС Паге.
САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је гел електрофореза
3. Шта је страница СДС
4. Упоредна упоредба - Гел електрофореза и СДС страница
5. Резиме
Гел електрофореза је уобичајена техника која се користи у лабораторијама за одвајање наелектрисаних молекула као што су ДНК, РНА, протеини итд. Од њихових смеша. Гел се користи у електрофорези гела. Делује као молекуларно сито. Постоје две врсте гелова који се користе у електрофорези гела, агароза и полиакриламид. Одабир гела и препарата гела важни су фактори које треба узети у обзир у гел електрофорези јер величину пора гела треба пажљиво манипулисати да би се добро раздвојило молекуле путем електрофорезе гела. Гел електрофореза има електрично поље повезано на два краја гела. Један крај гела показује позитивно наелектрисање, док је други крај негативно наелектрисан.
ДНК и РНА су негативно наелектрисани молекули. Једном када се ставе у гел са негативног краја гела и примене у електрично поље, они прелазе кроз поре гела према позитивно наелектрисаном крају гела. Брзина миграције зависи од набоја и величине молекула. Мањи молекули лакше мигрирају кроз поре гела у односу на веће молекуле. Дакле, мањи молекули путују велику удаљеност кроз гел, а већи молекули на малу удаљеност. За посматрање путовања молекула на гелу користе се посебне врсте боја. Електрично поље се примењује на одређени временски период и зауставља се да би се спречио губитак молекула и задржали молекули на њиховим превоженим положајима. У гелу се могу приметити различите траке. Ове траке представљају молекуле различитих величина. Дакле, гел-електрофореза је корисна за разликовање молекула према њиховој величини.
Гел електрофореза је уклопљена у различите технике као препаративну технику у молекуларној биологији, као што су ПЦР, РФЛП, клонирање, секвенционирање ДНК, јужњачка мрља, мапирање генома итд..
Слика 01: Електрофореза агарозног гела
Електрофореза натријум додецил сулфата полиакриламид гела (СДС Паге) је врста гел електрофорезе која се користи за одвајање протеина. Када се гел електрофореза користи за одвајање протеина, потребни су посебни третмани јер се протеини не наелектришу негативно попут ДНК и РНК и не мигрирају према позитивном или негативном крају. Стога се протеини денатуришу и премазују негативним набојем пре гел електрофорезе. Изводи се употребом детерџента званог натријум додецил сулфат (СДС). Гел електрофореза која користи СДС и полиакриламидни гел за носиви медијум позната је као СДС Паге. Ова техника се најчешће користи у биохемији, генетици, форензичкој медицини и молекуларној биологији.
Током СДС-а, протеини се мешају са СДС-ом. СДС савија протеине у линеарни облик и премаже их негативним набојем пропорционалним њиховој молекулској маси. Због негативног набоја, протеински молекули мигрирају према крају гела са позитивним наелектрисањем и раздвајају се у складу са њиховим молекуларним масама. У СДС Паге-у, полиакриламид се користи као чврсти носач гела. Стварно одвајање протеина углавном зависи од својстава гела. Дакле, припрему полиакриламидног гела треба пажљиво извршити и користити исправне концентрације полиакриламида. Полиакриламидни гелови показују већу резолуцију у односу на агарозе. Стога се СДС Паге сматра техником раздвајања протеина високе резолуције.
СДС Паге је врста денатурирајуће гел електрофорезе. Има велико ограничење у анализи протеина. Пошто СДС денатура протеине пре одвајања, не дозвољава откривање ензимске активности, интеракције везивања протеина, протеинских кофактора итд..
Слика 02: Страница СДС
Гел Елецтропхоресис вс СДС Паге | |
Гел електрофореза је метода која се изводи за одвајање макромолекула коришћењем електричног поља. | СДС Паге је техника електрофорезе гела високе резолуције која се користи за одвајање протеина на основу њихове масе. |
Гел Рун | |
Може се изводити хоризонтално или вертикално. | Страница СДС увек ради вертикално. |
Основе раздвајања | |
Одвајање настаје у складу са набојем и величином. | Одвајање протеина дешава се у складу са масом и набојем. |
Резолуција | |
Електрофореза гела од агарозе има малу резолуцију, а електрофореза гела са полиакриламидом већу резолуцију | Страница СДС-а има бољу резолуцију. |
Денатурација | |
Гел електрофореза укључује и технике денатурирања и денатурирање. | СДС Паге денатура протеине пре одвајања. |
Гел електрофореза је уобичајена техника која се користи за одвајање и анализу ДНК, РНК и протеина на основу њихове величине и набоја. Постоје две главне врсте гел електрофорезе, а то је агароза гел електрофореза и полиакриламидна електрофореза. Гелови од агарозе користе се углавном за одвајање нуклеинских киселина; када је потребна већа резолуција, користе се полиакриламидни гелови. СДС Паге је врста гел електрофорезе која се обично користи за одвајање сложених смеша протеина. Сматра се техником раздвајања протеина високе резолуције. Ово је разлика између гел електрофорезе и СДС Паге.
Референце:
1. Новаковски, Андрев Б., Виллиам Ј. Вобиг и Давид Х. Петеринг. „Нативе СДС-ПАГЕ: Електрофоретско раздвајање протеина високе резолуције са задржавањем нативних својстава, укључујући јоне повезане у металу. ввв.нцби.нлм.них.гов. Н.п., мај 2014. Веб. 7 апр 2017
2. Стеллваген, Нанци Ц. "Електрофореза ДНК у агарозним геловима, полиакриламидним геловима и у слободном раствору." Електрофореза. Америчка национална медицинска библиотека, јун 2009. Веб. 07. април 2017
Љубазношћу слике:
1. „Гелелектропхоресеаппаратур“ (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. "Електрофореза ДНА агарозним гелом" од стране Природних ресурса из Анн Арбор - ДНК лабораторија (ЦЦ БИ 2.0) преко Цоммонс Викимедиа