Разлика између изолације геномске ДНК и плазмидне ДНК

Тхе кључна разлика Између геномске ДНК и плазмидне изолације ДНК је то изолација геномске ДНК циља екстракцију геномске ДНК док изолација плазмидне ДНК циља екстракцију плазмидне ДНК бактерија.

Изолација ДНК је хемијски процес који се користи за изоловање ДНК од различитих врста или из различитих узорака. Изолација ДНК је важна у техникама молекуларне биологије низводно, попут гел електрофорезе, ланчане реакције полимеразе и техника секвенцирања ДНК. Стога је изолација ДНК суштински хемијски процес у молекуларно-биолошким студијама. На основу сврхе истраживања понекад је потребно изоловати геномску ДНК. Поред тога, неке студије усредсређују се на изоловање плазмидне ДНК из бактерија. Изолација геномске ДНК је процес изолације геномске ДНК из прокариотског или еукариотског узорка. Кораци изолације се разликују у зависности од типа ћелије у којој се ДНК изолује. Изолација плазмидне ДНК је процес изолације плазмидне ДНК из бактеријске ћелије. У поређењу са изолацијом геномске ДНК, целокупни процес је сложен у изолацији плазмидне ДНК.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је изолација геномске ДНК
3. Шта је изолација плазмидне ДНК
4. Сличности између геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК
5. Упоредно упоређивање - Изолација геномске ДНК вс плазмидне ДНК у табеларном облику
6. Резиме

Шта је изолација геномске ДНК?

Изолација геномске ДНК је процес издвајања целокупне геномске ДНК у организму. Овај одређени процес укључује три главна догађаја. То су ћелијска лиза или нуклеарна лиза, разградња протеина или протеолиза и таложење геномске ДНК. Корак лизе може да се разликује у зависности од типа ћелије. Код прокариота, с обзиром да постоји ћелијски зид пептидогликана, први корак би требало да буде пропадање ћелијског зида. С друге стране, код еукариота, корак лизе укључује распад плазма мембране и нуклеарне мембране да би се ДНК извукла у спољашњост. Супротно томе, посебни кораци су неопходни за лизирање ћелија и биљних зидова.

Слика 01: Изолација геномске ДНК

Због тога, једном када се заврши корак лизе, на крају ће ДНК доћи до супернатанта. Истовремено се у раствору дешава и разградња протеина захваљујући додатку протеиназе К. Следећи корак је одвајање геномске ДНК и разграђених протеина један од другог. Дакле, разграђени протеини се одвајају таложењем омогућавајући геномској ДНК да остане у супернатанту. После таложења протеина, геномска ДНК се може исталожити и поново суспендовати у погодном пуферу све док то не буде потребно за експеримент.

Геномска ДНК, која је линеарна ДНК, садржи сву генетску информацију организма. Другим речима, геном је наследни материјал живог организма који је одговоран за све структурне и функционалне активности ћелије. Састоји се од кодирајућих и некодирајућих низова ДНК. Када се изолује геномска ДНК, она укључује цео геном организма.

Шта је изолација плазмидне ДНК?

Изолација плазмидне ДНК је посебан и компликованији процес изолације ДНК. Плазмиди су екстрахромосомска ДНК присутна у већини бактеријских ћелија. Они су успавани кружни ДНК који подржава бактерије да преживе у тешким условима животне средине. Плазмидна ДНК се састоји од посебних резистентних гена који дају додатне предности бактеријама као што су отпорност на антибиотике, својства вируленције и токсична својства.

Слика 02: Изолација плазмидне ДНК

Изолација плазмидне ДНК такође укључује три главна процеса; ћелија лиза, протеинолиза и таложење ДНК. Иако је биохемијски механизам изолације сличан механизму изолације геномске ДНК, поступак је сложенији од њега. Процес лизирања ћелија најважнији је поступак у овом поступку. Најбитније је да се геномска ДНК и плазмидна ДНК не смеју мешати једна са другом. Због тога се у поступак изолације плазмидне ДНК уграђује много блажи поступак лизе. Стога се у већини поступака за изолацију плазмидне ДНА користи детерџент; натријум додецил сулфат за лизу ћелије.

Које су сличности између геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК?

• Изолација геномске ДНК и плазмидне ДНК фокусирана је на екстракцију ДНК из организма.
• Такође, обе следе исти укупан процес који укључује лизу ћелије, разградњу протеина и таложење ДНК.
• Штавише, резултирајућа ДНК оба процеса важна је за процесе који иду даље.
• Штавише, оба поступка изолације укључују кораке за пречишћавање и чување ДНК под одређеним условима складиштења.
• Поред тога, протеиназа К се користи у обе методе за разградњу протеина.

Која је разлика између изолације геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК?

Изолација геномске ДНК фокусирана је на издвајање целе геномске ДНК циљног организма, док се изолација плазмидне ДНК фокусира на изоловање само плазмидне ДНК из одређене бактеријске врсте. Стога је ово кључна разлика између геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК. Штавише, још једна разлика између изолације геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК је у процедури. Изолација геномске ДНК је мање сложен поступак у поређењу са изолацијом плазмидне ДНК. Дакле, приликом изоловања плазмидне ДНК неопходно је предузети мере предострожности како би се спречило мешање геномске и плазмидне ДНК међусобно.

Ниже инфограохиц даје даље детаље о разлици између изолације геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК.

Преглед - Изолација геномске ДНК вс плазмидне ДНК

Изолација ДНК је важан процес у техникама молекуларне биологије. Постоје две врсте ДНК, наиме геномска ДНК и плазмидна ДНК (екстра хромосомска ДНК). На основу захтева, неки поступци спроведени су за изолацију геномске ДНК док се неки поступци фокусирају на изолацију само плазмидне ДНК из бактерија. Стога се кораци у оба процеса мало разликују један од другог. Међутим, целокупни поступак је исти у обе изолације. Изолована ДНК оба процеса има огромну употребу у низводним процесима као што су клонирање, гел електрофореза и ланчане реакције полимеразе. На крају протокола изолације геномске ДНК, целокупна геномска ДНК организма може бити изолована као крајњи производ док на крају протокола изолације плазмидне ДНК плазмидна ДНК одговарајуће бактерије може да буде изолована као крајњи производ. Стога је ово разлика између изолације геномске ДНК и изолације плазмидне ДНК.

Референце:

1. "ИЗЛУЧИВАЊЕ ДНК ИЗ БАКТЕРИЈЕ." Извлачење ДНК из бактерија. Доступно овде 

Љубазношћу слике:

1. "ДНК екстракција" Јоо Натх - сопствени рад, (ЦЦ БИ-СА 4.0) преко Цоммонс Викимедиа 
2. "Мини плаз плазмида" Ретама - Властити рад, (ЦЦ БИ-СА 4.0) преко Цоммонс Викимедиа