Разлика између генотипизације и секвенцирања

Кључна разлика - генотипизација вс секвенција
 

Генотипизација и секвенционирање су две технике које се изводе ради добијања информација о нуклеинским киселинама, углавном ДНК организма. Кључна разлика између генотипизирања и секвенцирања је та генотипизација је поступак утврђивања коју генетску варијанту појединац поседује користећи маркере, док је секвенционирање одређивање тачног редоследа нуклеотидне секвенце у датом фрагменту ДНК.

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је генотипизација
3. Шта је секвенцирање
4. Упоредно упоређивање - генотипизација вс секвенција
5. Резиме

Шта је генотипизација?

Генотипизација је одређивање генетске структуре појединца употребом секвенце ДНК и маркера и упоређивање и идентификација његовог наслеђа. Генотипизација је важна у еволуцијској биологији, популационој биологији, таксономији, екологији и генетици организама. Може се извести различитим техникама, укључујући секвенцирање ДНК, ланчану реакцију полимеразе, полиморфизам дужине рестриктивног фрагмента (РФЛП), случајно појачано полиморфно откривање, полиморфизам дужине фрагментираног фрагмента (АФЛП), ДНК микрорачуне, итд..

Генотипизација укључује секвенцирање појединих малих фрагмената ДНК секвенце и проналажење повезаности генетског састава са другим појединцима користећи генетске маркере. Одређује полиморфизме појединих нуклеотида (СНП) међу појединцима или специфичним алелима. Генотипизација је применљива на широк спектар организама, укључујући људе. Такође се примењује на микроорганизме попут вируса, гљивица итд. И може се користити за одређивање њихових генетских варијанти референтним профилима. У молекуларној епидемиологији и форензичкој микробиологији контрола патогена, посебно микроорганизама, врши се информацијама добијеним генотипизацијом. Генотипизација је веома важна у педигрејској анализи. Људи су генотипизирани како би потврдили мајчинство и очинство. Генотип ће открити доминантне и рецесивне алеле гена који одређују специфичне особине.

Слика_1: РФЛП генотипизација

Шта је секвенционирање?

Секвенцирање је процес утврђивања тачног редоследа нуклеотида у датом фрагменту ДНК или РНК. Готово све информације потребне за раст и развој организма су кодиране у његовом геному. Доступност техника за производњу и одвајање неколико стотина нуклеотида дугих фрагмената нуклеинских киселина довело је до развоја поступака за одређивање тачне нуклеотидне секвенце датог фрагмента ДНК или РНК. Данас су доступне различите врсте секвенцирања. Ове методе секвенцирања, заједно са технологијама за изградњу библиотека генома који представљају цео геном организма, олакшавају секвенцирање целог генома тог организма, дубинском анализом генских структура, функција гена, локација гена, експресије гена, картирање гена, региони гена итд.

Укупни геноми многих вируса, неколико бактерија, архебактерија, квасца и неколико других организама су секвенционирани и мапирани. Пројект хуманог генома омогућио је секвенцирање и мапирање читавог људског генома и објавио његов први нацрт 2003. То је велика прекретница у напретку биологије. Секвенце људског генома данас се користе у медицинском сектору за идентификацију генетских узрока ретких болести, ризик од сцреенинг болести код новорођенчади, идентификацију генетских детаља различитих карцинома, развој нових терапија и развој нових дијагностичких алата итд..

У биљном свету су секвенционирани геном пиринча и геноми Арабидопсис. Познавање ових секвенци несумњиво ће променити наше разумевање функционисања ћелија и организама.

Слика_2: Ауторадиограф сангер секвенце

Која је разлика између генотипизације и секвенцирања?

Генотипизација вс секвенција
Генотипизација је поступак утврђивања генетског састава појединца и провере групе или таксономије тог организма.	Секвенцирање је поступак одређивања тачног реда нуклеотида датог ДНК или РНА фрагмента.
Технике
РФЛП, секвенце гена, ПЦР, ДНК микрорачуни, АФЛП итд.	Сигурније секвенцирање, Гилбертово секвенцирање, Пирокњижење, Следење нове генерације, Секвенце пушака итд.
Велика забринутост
Ово је више забринуто око тога да ли разлике у генотипу дају стварне разлике у фенотипу.	То је више забринуто због редоследа нуклеотида и његових разлика и промена са другим организмима.

Преглед - Генотипизација вс секвенција

Генотипизација и секвенционирање корисни су за проучавање генетских информација организама. Генотипизација је процес утврђивања варијација генотипа међу појединцима и проналажења њихових категорија. Секвенцирање је поступак утврђивања тачног редоследа нуклеотида у заинтересованом фрагменту или у региону ДНК. Обе технике дају важне информације о генима и генима.

Референце:
1. "Методе генотипизације." Методе у молекуларној биологији (Цлифтон, Н. Ј.). Америчка национална медицинска библиотека, н.д. Веб. 20 феб. 2017.
2. Акеи, Ј. М., Д. Сосноски, Е. Парра, С. Диос, К. Хеистер, Б. Су, Ц. Бонилла, Л. Јин, и М. Д. Схривер. „Анализа кривуље топљења СНП-а (МцСНП:): Приступ без гелова и јефтин приступ за СНП генотипизацију.“ БиоТецхникуес 30.2 (2001): 358-67. Веб.

Љубазношћу слике:
1. „РФЛП генотипизација“ Аутор (непознато) - Национални здравствени институти (јавно доменство) преко Цоммонс Викимедиа
2. "Радиоактивни флуоресцентни" Абизар на енглеској Википедији (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа