Разлика између Ницк-овог превода и продужења примера

Кључна разлика - Ницк превод вс Ектенсион Пример
 

Превод Ника и продужење примера две су важне технике изведене у Молекуларној биологији. Кључна разлика између превођења надимака и наставка примера је у томе Ницк процес превођења производи обележене сонде за остале технике хибридизације док метода екстензије прајмера идентификује специфичну РНК секвенцу из смеше и открива информације о експресији мРНА. Обе технике имају велику важност и рутински се изводе у лабораторијима за молекуларна истраживања.

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је превод Ницк-а
3. Шта је Ектенсион Пример
4. Упоредна успоредба - Ницк Транслатион вс Пример Ектенсион
5. Резиме

Шта је превод Ницк-а?

Превод Ник-а је важна техника која се користи да се припреме обележене сонде за разне молекуларно-биолошке технике као што је брисање, ин ситу хибридизација, флуоресцентна ин ситу хибридизација итд. То је ан ин витро метода обележавања ДНК. ДНК пробе се користе за идентификацију специфичних секвенција ДНК или РНК. Помоћу обележене сонде, специфични фрагменти се могу обележити или визуализовати из сложене мешавине нуклеинске киселине. Због тога се обележене сонде припремају различитим техникама које се користе за различите технике. Ницк превод је једна таква метода која производи обележене сонде уз помоћ ензима ДНасе 1 и ДНА полимеразе 1.

Процес превођења ницк-а започиње с активношћу ензима ДНасе 1. ДНаза 1 уводи квржице у фосфатну краљежницу дволанчане ДНК цијепањем фосфодиестерских веза између нуклеотида. Једном када се створи надимак, 3 'ОХ група нуклеотида ће се добити и ензим ДНК полимераза 1 ће на њега деловати. Активност егзонуклазе 5 'до 3' ДНК полимеразе 1 уклања нуклеотиде из ника према 3 'правцу ланца ДНК. Истовремено, полимеразна активност ензима ДНК полимераза 1 делује и додаје нуклеотиде који замењују уклоњене нуклеотиде. Ако су нуклеотиди обележени, замена ће се догодити обележеним нуклеотидима и то ће обележити ДНК за идентификацију. Ова ново синтетизована обележена ДНК може се користити као сонде у различитим реакцијама хибридизације у Молекуларној биологији.

Слика 01: Процес превођења Ницка

Шта је Ектенсион Пример?

Продужење примера је техника која се користи за проналажење специфичне РНА секвенце из смеше РНА и проналажење 5 'краја мРНА транскрипта. Такође се користи за проучавање структуре РНА и експресије. Метода продужења примера се изводи са обележеним прајмерима или са обележеним нуклеотидима. Ако се користе обележени прајмери, то искључује потребу за обележавањем нуклеотида који се користе за синтезу цДНА. Постоји неколико корака у овој техници. Почиње екстракцијом РНА из узорка. Затим се обележени олигонуклеотидни прајмер додаје смеши заједно са потребним састојцима за синтезу цДНА специфичне РНА секвенце. Прајмер се лечи са комплементарном секвенцом из смеше. Користећи секвенцу ојачену прајмером као предложак, реверзна транскриптаза ензима синтетише комплементарну ДНК (цДНА) секвенце РНА. Паљење прајмера и реверзна транскрипција настају само када је у узорку присутна специфична РНА секвенца. Коначно, када се врши денатурација гел електрофореза, може се одредити величина РНА секвенце. Такође је лако пронаћи +1 базу секвенце мРНА (место иницијације транскрипције) методом продужења примера. Количина мРНА присутна у узорку може се квантификовати овом методом ако се користи вишак прајмера.

Слика 02: Продужни пример

Која је разлика између превода Ницк-а и продужевања примера?

Ницк Транслатион вс Пример Ектенсион
Превод Ник-а је процес који ствара обележене ДНК сонде за различите реакције хибридизације.	Продужење примера је техника која се користи за проналажење специфичне РНА или за испитивање експресије гена.
Ензими који се користе
Користе се ензими ДНаза 1 и ДНК полимераза.	Користи се ензим за реверзну транскриптазу.
Значај
Превод Ницк-а олакшава обележавање специфичног низа ДНК.	Продужење примера омогућава откривање специфичне величине мРНА секвенце и количине присутне у узорку.

Преглед - Ницк Транслатион вс Пример Ектенсион

Ницк превод је метода која се користи за синтезу означених сонди заснованих на активностима ДНасе 1 и Е цоли Ензими ДНК полимеразе 1. То је ин витро метода примењена у лабораторијама пре различитих техника хибридизације. Током ницк транслације, 5'-3 'егзонуклезална активност ДНК полимеразе 1 уклања нуклеотиде испред ник-а, а полимеразна активност ДНК полимеразе 1 замењује уклоњене нуклеотиде обележеним нуклеотидима иза надимка. Проширење прајмера је метода која се користи за откривање специфичног РНК транскрипта из смеше и квантификује величину и количину РНА. Ово је разлика између превођења надимака и екстензије примера.

Референце
1. Реид, Алек. "Ницк Транслатион." Спрингер. Н.п., н.д. Веб. 18 апр 2017
2. „Пример продужења.“ Национална дијагностика. Н.п., н.д. Веб. 19 апр 2017
3. Куо, М. Т. и В. Плункетт. „Ницк-превод метафазних хромозома: ин витро обележавање нуклеарно осетљивих региона у хромосомима.“ Зборник радова Националне академије наука Сједињених Америчких Држава. Америчка национална медицинска библиотека, фебруар 1985. Веб. 19 апр 2017
4. Раимонд и др. „Једноставан, квантитативан ПЦР тест за екстензију прајмера за директно надгледање микроРНА и РНА са кратким интерфејсом.“ РНА. Цопиригхт 2005 од РНА Социети, новембар 2005. Веб. 19 апр 2017

Љубазношћу слике:
1. „Пример продужења примера“ аутор Јјнммњј - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа