Разлика између протеомике и транскриптомике

Кључна разлика - протеомика вс Трансцриптомицс
 

Омиц технологија је актуелни тренд, где се на различите биомолекуле организма гледа као на целокупну колекцију с обзиром на њена својства и функције. Омиц технологија има широк спектар примена. Различите омице биолошког узорка укључују геномику, протеомику, транскриптомику и метаболомију. Протеомицс укључује комплетно проучавање свих протеина у живом организму. Дефинише се као скуп свих експримираних протеина у организму, његових структурних и функционалних својстава. Комплетан сет протеина, дакле, формира протеоме. Трансцриптомицс је комплетно проучавање свих молекуларних РНА (мРНА) молекула присутних у живом организму. Дакле, транскриптомија се бави генима који се активно експримирају у живом организму. Укупни скуп мРНА у живом организму назива се транскриптом. Тхе кључна разлика између протеомике и транскриптомике заснива се на врсти биомолекуле. У протеомици се проучава укупан скуп изражених протеина у живом организму, док се у транскриптомији проучава укупна мРНА живог организма..

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је Протеомицс
3. Шта је транскриптомија
4. Сличности између протеомике и транскриптомике
5. Упоредно упоређивање - Протеомицс вс Трансцриптомицс у табеларном облику
6. Резиме

Шта је Протеомицс?

Израз протеомика је скован 1995. године и првобитно је дефинисан као укупни протеински комплемент у ћелији, ткиву или организму. Како је напредовао у протеомским студијама, он је затим модификован да би се сматрао кровним термином у који су укључена многа подручја истраживања. Тренутно се под темом протеомика проучавају структура, оријентација, функције, њене интеракције, модификације, примене и значај протеина. Стога се тренутно проводи много истраживања из области протеомике.

Прве протеомске студије урађене су да би се утврдио садржај протеина у Есцхерицхиа цоли. Мапирање укупног садржаја протеина урађено је коришћењем дводимензионалних (2Д) гелова. Након успеха овога, научници су прешли на карактеристику укупног садржаја протеина у животињама попут замораца и мишева. Тренутно се мапирање протеина човека врши помоћу 2Д гел електрофорезе.

Примене Протеомицс-а

Много је предности проучавања протеомике, јер су протеини водећи молекули већине активности због својства катализатора протеина. Дакле, проучавање целих протеина може пружити информације о здравственом стању организма. Неке апликације су;

1. Напомена за геном: Проучавањем садржаја протеина у организму могу се утврдити тачни геноми одговорни за активно протеинско једињење. У овом сценарију су важни резултати свих генома, транскриптомија и протеомика.
2. Идентификација болести / дијагностика болести: Протеомицс се користи за идентификацију стања болести, поређењем здравих и болесних
3. Изнети експресија протеина проучавали током експериментирања.
4. Модификације протеина и студије интеракције: Да би се користили протеини витро услови или и ин виво услова, да одреде услове чувања ових екстрахираних протеина и да проуче понашање протеина у ин витро, ин виво и - силиконске методе.

Слика 01: Протеомика

У протеомику постоје различите технике

1. Екстракција укупног протеина и одвајање протеина коришћењем 2Д гел електрофорезе. Протеини се такође могу раздвојити помоћу течне хроматографије високих перформанси (ХПЛЦ).
2. Секвенцирање екстрахираних протеина коришћењем метода као што је Едмунд-ова метода секвенцирања или масеном спектрометријом.
3. Једном када се идентификују секвенце, структурна и функционална својства садржаја протеина се анализирају помоћу рачунарског софтвера и биоинформатичких алата.

Шта је Трансцриптомицс?

Транскриптни појам скован је недавно. Транскриптомија је проучавање укупног садржаја мРНА у организму. Укупна мРНА је изражена ДНК у живом организму или ћелији. Комплетна колекција мРНА назива се транскриптом.

Кораци ка анализи транскрипта укључују,

1. Екстракција РНА, одвајање мРНА уз употребу колонске гел хроматографије са поли ДТ перлама.
2. Завршено је секвенцирање мРНА.

Мицроарраи технологија је један од уобичајених начина идентификације транскрипта организма. Техника микрорачунања укључује плочу сонде са комплементарним жицама транскрипта. После хибридизације, мРНА присутна у организму или ћелијама може да се карактерише.

Слика 02: Транскриптомске технике

Трансцриптомицс се данас широко користи у медицини. Дијагностика болести и профилирање болести главна су поља у којима се користи Трансцриптомицс. Анализом транскрипта организма може се идентификовати страна мРНА, а ако постоје неке инфекције, може се идентификовати. Некодирајућа РНА може се одвојити коришћењем транскриптомских технологија. Такође се може надгледати и експресија гена под различитим стресима околине.

 Које су сличности између протеомике и транскриптомике?

• Обоје чине део концепта омиц технологије.
• Обоје се користе у дијагностици болести и карактеризацији болести организма.
• Обе области истраживања укључивале су екстракцију биомолекуле, одвајање биомолекуле и кораке секвенцирања.

Која је разлика између протеомике и транскриптомике?

Протемицс вс Трансцриптомицс
Протеомицс укључује комплетно проучавање свих протеина у живом организму.	Трансцриптомицс је комплетно проучавање свих молекуларних РНА (мРНА) молекула присутних у живом организму.
Проучавао био-молекуларни тип
Протеини се проучавају у протеомици.	мРНА се проучава у транскрипторији.
Студирани фактори
Структура, функција, интеракције, модификације и примене протеина проучавају се у протеомици.	Структура редоследа, интеракције са околином и примене мРНА проучавају се у транскриптомији.

Преглед - Протеомицс вс Трансцриптомицс 

Омици играју важну улогу у пољу наука о животу. Протеомицс се односи на проучавање протеома који формира комплетне колекције протеина у ћелији или организму. Трансцриптомицс се односи на проучавање транскрипта који је комплетан скуп изражене ДНК који је у облику мРНА. Две области истраживања, протеомика и транскриптомија, изведене су након увођења геномике и тренутно се широко користе у медицинској дијагностици и у карактеризацији и скринингу организама. Ово је разлика између протеомике и транскриптомике.

Преузмите ПДФ од Протеомицс вс Трансцриптомицс

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде: Разлика између Протеомицс и Трансцриптомицс

Референце:

1.Хорган, Рицхард П и Лоуисе Ц Кенни. „Омичке“ технологије: геномика, транскриптомија, протеомика и метаболомика. “ Акушер и гинеколог, Блацквелл Публисхинг Инц, 18. јула 2011. Доступно овде  
2.Гравес, Паул Р. и Тимотхи А. Ј. Хаистеад. "Водич за молекуларну биологију за протеомику." Рецензије о микробиологији и молекуларној биологији, Америчко друштво за микробиологију, мар. 2002. Доступно овде
3.Лове, Рохан и др. „Технологије транскриптомике“. ПЛоС Цомпутатионал Биологи, Публиц Либрари оф Сциенце, мај 2017. Доступно овде  

Љубазношћу слике:

1.'Протеомицс'Би Кскл7441 на енглеском Викибоокс - Пребачен из ен.викибоокс у Цоммонс., (Публиц Домаин) преко Цоммонс Викимедиа
2.'Мицроарраи и секвенцирање ћелије протока 'Тхомас Схафее - Властити рад (ЦЦ БИ 4.0) преко Цоммонс Викимедиа