Разлика између КТЛ и ГВАС

Тхе кључна разлика између КТЛ и ГВАС се ослања на врсту наставка који се користе у анализи. КТЛ користи локне гена за анализу фенотипских особина повезаних са наследјем полгена, док ГВАС користи читаве секвенце генома за анализу полиморфизама појединачних нуклеотида одређеног стања.

КТЛ мапе и ГВАС играју важну улогу у генетским анализама за различите особине. Надаље, они су важни у анализи различитих стања болести с непознатом етиологијом. Поред тога, секвенцирање игра кључну улогу у обје технике. Ове технике се даље могу спојити са другим техникама високог протока ради веће тачности и прецизности.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је КТЛ 
3. Шта је ГВАС
4. Сличности између КТЛ-а и ГВАС-а
5. Упоредна упоредба - КТЛ и ГВАС у табеларном облику
6. Резиме

Шта је КТЛ?

КТЛ значи Квантитативни локус својства. То је подручје ДНК повезано с фенотипском особином. Генерално, КТЛ изазива полигене ефекте. Расподјела КТЛ-а варира, а број КТЛ-ова сугерише степен варијације одређене фенотипске особине. Надаље, они обично кодирају основне темељне особине, а не дискретне особине.

Након идентификације КТЛ региона, важно је да се секвенционише одређено КТЛ подручје. Штавише, да би се олакшало истраживање и истраживање, одвијање секвенце и чување података о секвенци из заједничких КТЛ регија уз учешће биоинформатике. Ми називамо ову технику КТЛ мапирање. Након тога, база података изграђује се са КТЛ регионом секвенце.

Слика 01: КТЛ скенирање

Надаље, примјена КТЛ секвенци углавном се ослања на БЛАСТ алат, гдје се може одредити сличност секвенци. Важно је у одређивању односа између организама. Надаље, важно је у одређивању сложености одређеног полигеног фенотипа. Такође одређује еволуцију одређене особине.

Тренутно се КТЛ анализа комбинује са другим техникама високе пропусности попут ДНК микроралома. Ово је важно у експресијској анализи фенотипа. Тренутно су научници веома заинтересовани за развој КТЛ базе података јер су КТЛ региони одговорни за многе важне особине различитих врста.

Шта је ГВАС?

ГВАС значи Студија удруживања генома широког облика. Такође се односи на студије о повезивању читавих генома. Ове студије су усредсређене углавном на опсервацијске студије. Анализира генетске варијанте различитих јединки које су обично повезане са одређеном особином. Штавише, за ГВАС анализу важан је цео геном.

Слика 02: ГВАС

ГВАС је важно средство у анализи појединачних нуклеотидних полиморфизама повезаних са различитим болестима. Ово је такође упоредна студија различитих полиморфизама са једним нуклеотидом код широке популације. Поред тога, узорак студије ГВАС је веома висок; стога узима и формат кохортне студије попречног пресека.

Поред тога, прва ГВАС студија одржана је у вези са инфарктом миокарда и анализом гена повезаних са инфарктом миокарда. Тренутно, ГВАС игра важну улогу у одређивању генетске позадине сложених болести непознате етиологије.

Које су сличности између КТЛ-а и ГВАС-а?

• За анализу се ослањају на податке о ДНК секвенци.
• Обоје су повезани са генетском позадином различитих ликова.
• Поред тога, потребни су им биоинформатички алати за утврђивање и тумачење резултата.
• Они се раде на великој популацији.

Која је разлика између КТЛ-а и ГВАС-а?

КТЛ анализира фенотипске особине повезане са полигеним наследјем користећи повезане генске локусе, док ГВАС анализира полиморфизме једног нуклеотида одређеног стања користећи читаве секвенце генома. Дакле, ово је кључна разлика између КТЛ-а и ГВАС-а. КТЛ пресликавање је упоредно мање сложена техника од ГВАС-а, јер захтева секвенце генома.

Подаци у наставку сумирају разлику између КТЛ и ГВАС у табеларном облику.

Преглед - КТЛ вс ГВАС

КТЛ пресликавање и ГВАС играју главну улогу у одређивању генетске позадине различитих фенотипских карактеристика. Такође помажу у анализи генетске позадине различитих болести. КТЛ мапирање пресликава гене за повезивање који су одговорни за континуиране особине, а такође укључује мапирање гена за генетичко наслеђивање. ГВАС се, с друге стране, одвија са целим геномима анализирајући полиморфизме са једним нуклеотидом. Поред тога, ово се дешава код веће популације. Дакле, ово је резиме разлике између КТЛ-а и ГВАС-а.

Референце:

1. Лиу, Руикиан и др. „ГВАС анализа и КТЛ идентификација особина квалитета влакана и компонената приноса у памучном памуку помоћу обогаћених СНП маркера високе густоће.“ Фронтиерс ин Плант Сциенце, Фронтиерс Медиа С.А., 13. септембра 2018., Доступно овде.
2. “ГВАС вс. Ктл Мапирање? " Најновије поруке, доступне овде.

Љубазношћу слике:

1. „Пример КТЛ-скенирања на читавом геному из ПЛоС биологије“ - Стиркарсдоттир У, Цазиер ЈБ, Конг А, Ролфссон О, Ларсен Х, ет ал. (2003) Повезаност остеопорозе са хромосомом 20п12 и асоцијација на БМП2. ПЛоС Биол 1 (3): е69 (ЦЦ БИ 2.5) преко Цоммонс Викимедиа
2. „Ефекти алела од болести ГВАС“ ​​Бусх ВС и Мооре ЈХ - Бусх ВС, Мооре ЈХ (2012) Поглавље 11: Студије генома широке асоцијације. ПЛоС Цомпут Биол 8 (12): е1002822. дои: 10.1371 / јоурнал.пцби.1002822, (ЦЦ БИ 2.5) виа Цоммонс Викимедиа