Разлика између Т4 и Т7 ДН лигазе

Кључна разлика - Т4 вс Т7 ДН лигаза
 

ДНК лигаза је важан ензим који се користи у техникама молекуларне биологије. Он функционише као молекуларно лепак за спајање нуклеотида, формирајући фосфодиестерске везе између нуклеотида. Фосфодиестерске везе настају између 3 'хидроксилног краја шећерне групе и 5' крајње фосфатне групе. ДНК лигаза је од виталног значаја за процес репликације да би се придружили Оказаки фрагментима заосталог ланца и током механизама поправке ДНК и ин витро експерименти са клонирањем како би се придружили жељеном гену од интереса за векторски геном. Постоје две главне ДНК лигазе које тренутно користе молекуларни биолози: Т4 и Т7 ДН лигазе. Т4 ДН лигаза један је од првих ензима који су изоловани из Т4 бактериофага. Т7 ДН лигаза, која је мањи протеин, је ензим изолован из Т7 бактериофага. Ово је кључна разлика између Т4 и Т7 ДН лигаза.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је акција ДНА лигазе
3. Шта је Т4 ДН лигаза
4. Шта је Т7 ДН лигаза
4. Сличности између Т4 и Т7 ДНА лигазе
5. Упоредна упоредба - Т4 вс Т7 ДН лигаза у табеларном облику
6. Резиме

Шта је акција ДНА лигазе?

Лигација ДНК догађа се у реакцији у три корака. Први корак је нуклеофилни напад на алфа-фосфор АТП-а, стварајући ковалентни ензим-адилатни интермедијер у коме је АМП повезан са крајњим азотом бочног ланца лизина. У другом кораку, нуклеофилни напад се догађа на фосфору ензима-аденилат помоћу 5'-фосфатног окончаног супстрата ДНК, ослобађајући лизин и формирајући ДНК-аденилат. У завршном кораку, ДНА-аденилат напада 3'-ОХ другог ланца ДНК, ослобађајући АМП и придружујући се полинуклеотидима.

Шта је Т4 ДН лигаза?

Т4 лигаза је прва лигаза коју су Меселсон, Веигле и Келленбергер изолирали и идентификовали и била је прва икада произведена комерцијална лигаза. Т4 ДН лигаза је ензим зависан од АТП-а који катализује стварање фосфодиестерских веза. То је један полипептидни ланац са 487 остатака аминокиселина и има молекулску масу од око 77 кДа. Оптимални пХ за његову активност налази се у распону од 7,5 - 8.

Слика 01: Т4 ДН лигаза

Т4 ДН лигаза, као што јој име каже, присутна је у бактериофагу Т4 и изолована је када је фаг произвео ензим након инфекције са -Е. цоли. Ензим лигата двостраним ДНК дуплексима са тупим крајевима, а фрагменти које треба везати треба да буду у непосредној близини један са другим.

Шта је Т7 ДН лигаза?

Т7 лигаза је протеин од 41 кДа произведен од Т7 бактериофага и изолован је инфекцијом Е. цоли ћелије. Главна функција Т7 лигазе је везање дуплекса ДНА кроз фосфодиестерске везе и спајање оближњих фрагмената ДНК током експеримената са клонирањем. Оптимални пХ за Т7 ДН лигазу налази се у распону од 7,0 до 7,2. Т7 лигаза зависи од АТП-а. ДНК лигазе Т7 такође су способне да жаре ДНК и РНА хибриде, што доводи до ненормалних конформација током транскрипције; међутим, овај феномен је још увек под истрагом ин витро студије.

Које су сличности између Т4 и Т7 ДНК лигазе?

• Т4 и Т7 ДНА лигаза учествују у реакцији лигације жарећи дуплексе ДНК кроз формирање фосфодиестерске везе између 3 'ОХ краја и 5' фосфатног краја фрагмента ДНК.
• Оба ензима лигата су тупим ДНК дуплексима који су у непосредној близини једни са другима.
• Оба ензима зависе од АТП-а.
• Ови ензими су изоловани инфицирањем Е. цоли ћелије са одређеним бактериофагом.
• Примена оба ензима укључује:
  • Молекуларно клонирање - за везање гена од интереса за вектор
  • Поправак ДНК - за поправак двочланих ниша
  • Репродукција ин витро ДНК
  • Ланчана реакција лигазе

Која је разлика између Т4 и Т7 ДНК лигазе?

Т4 вс Т7 ДН лигаза
Т4 ДН лигаза врста ДН лигазе изолована из бактериофага Т4 и укључује се у лигацију суседних фрагмената ДНК путем формирања фосфодиестерске везе.	Т7 ДН лигаза врста ДН лигазе изолована из бактериофага Т7 и укључује се у лигацију суседних фрагмената ДНК путем формирања фосфодиестер везе.
Величина протеина
Величина Т4 ДН лигазе је 77 кДа - већа у поређењу са Т7 ДН лигазом.	Величина Т7 ДН лигазе је 41 кДа.
Оптимални пХ
Распон пХ који делује код Т4 ДН лигазе је 7,5 - 8,0.	Распон пХ који делује код Т7 ДН лигазе је 7,0 - 7,2.

Преглед - Т4 вс Т7 ДН лигаза

ДНК лигазе су важна класа ензима који учествују у молекуларном клонирању да би се произвели рекомбинантни молекули ДНК који садрже ген који нас занима. Реакција лигације је реакција која користи енергију и у току су нове истраживачке студије за побољшање тачности модулацијом расположивих лигаза. Т4 и Т7 ДН лигазе су две врсте важних ензима ДНК лигазе који се користе у молекуларно-биолошким техникама. Т7 ДН лигаза такође је резултат истраживања које је засновано на примарној лигази изолованој од Т4 заражених Е. цоли. Т7 представља већу ефикасност и тачност у обављању своје функције због мање величине. Ово је разлика између Т4 и Т7 лигазе.

Преузмите ПДФ верзију Т4 вс Т7 ДНА Лигасе

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напоменама. Молимо преузмите ПДФ верзију овде Разлика између Т4 и Т7 Лигасе.

Референце:

1. "ДНК лигаза, Т4." ДНК лигаза, Т4 - Приручник за ензим Вортхингтон, доступан овде. Приступљено 22. августа 2017.
2. Дохерти, Аидан Ј. и др. „Бактериофаг Т7 ДНК лигаза ОВЕРЕКСПРЕССИОН, ПУРИФИКАЦИЈА, КРИСТАЛИЗАЦИЈА И КАРАКТЕРИЗАЦИЈА.“ Часопис за биолошку хемију, 10. мај 1996., доступан овде. Приступљено 22. августа 2017.

Љубазношћу слике:

1. "Слика 3. Једнострука везана мРНА-ДНК Т4 ДНА лигаза одвојеног помагала." (ЦЦ БИ 3.0) преко Цоммонс Викимедиа