Разлика између ВНТР и СТР

Кључна разлика - ВНТР вс СТР
 

ДНК студије имају огромну корисност у разумевању и утврђивању филогенетских односа, дијагностицирању генетских болести и мапирању генома организма. Неколико техника повезаних са ДНК анализом користи се за идентификацију одређеног гена или ДНК секвенце у групи непознатих ДНК. Познати су као генетски маркери. Генетски маркери се користе у молекуларној биологији за идентификацију генетске варијације између јединки и врста. Варијабилно понављање тандема са бројевима (ВНТР) и кратко понављање у тандему (СТР) две су врсте генетских маркера који показују полиморфизам код појединаца. Обе врсте су некодирајућа понављајућа ДНК која су тандемска понављања. Они су поредани хромосомима од главе до репа. ВНТР је део генома где се кратки нуклеотидни низ понавља неколико пута. СТР је још један одељак ДНК у геному који је организован као понављајуће јединице које се састоје од два до тринаест нуклеотида у сто пута. Кључна разлика између ВНТР и СТР је број нуклеотида у понављајућој секвенци. Понављајуће јединице ВНТР састоје се од 10 до 100 нуклеотида док се понављајућа јединица СТР састоји од 2 до 13 нуклеотида. ВНТР и СТР се широко користе у форензичким студијама.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је ВНТР 
3. Шта је СТР
4. Сличности између ВНТР и СТР
5. Упоредна упоредба - ВНТР вс СТР у табеларном облику
6. Резиме

Шта је ВНТР?

Понављање у тандему је кратак низ ДНК који се понавља „од главе до репа“ на одређеном хромосомском локусу. Не постоји друга секвенца или нуклеотид унутар понављања тандема. Постоји неколико врста понављања тандема у геному. ВНТР је врста понављања тандема међу њима која има понављајуће јединице које се састоје од 10 до 100 нуклеотида. ВНТР је врста мини сателита. Ова понављања у тандему могу се наћи у многим хромозомима. Они су испреплетени унутар људског генома и налазе се претежно у субтеломерним регионима хромозома.

 ВНТР-и показују полиморфизам у тандему који се понавља код појединаца. Дужина ВНТР-а на одређеној локацији хромозома веома је променљива међу појединцима због варијације у броју јединица које се понављају у том одсеку ДНК. Стога се ВНТР може користити као моћан алат за идентификацију појединаца, а ВНТР анализа се користи у многим областима, укључујући генетику, биолошка истраживања, форензику и штампање ДНК прста. ВНТР су били први генетски маркери који су коришћени за квантификацију уградње трансплантације коштане сржи. ВНТР су такође били први полиморфни маркери који су коришћени за ДНК профилисање у форензикама.

Слика 01: Варијација ВНТР код шест појединаца

ВНТР анализа се врши путем полиморфизма дужине рестрикционог фрагмента, праћеног јужном хибридизацијом. Дакле, потребан јој је упоредно велики узорак ДНК. Тумачење ВНТР профила је такође проблематично. Због ових ограничења, употреба ВНТР-а у форензичкој генетици је ограничена и замењена је СТР анализом.

Шта је СТР?

СТР је јако понављајући одељак ДНК који се састоји од две до тринаест нуклеотидних понављајућих јединица које су организоване у тандему. СТР је сличан ВНТР. Али варира од ВНТР од броја нуклеотида у редоследу који се понавља и броја понављања. СТР је врста микросателита.

СТР анализа укључена у мерење тачног броја јединица које се понављају. СТР-ови су врло варијабилни међу појединцима, слично ВНТ-овима. СТР профили се разликују од особе до особе. Због тога се СТР молекуларна анализа користи у молекуларној биологији да би се упоредили одређени локуси на ДНК из два или више узорака. Због тога се СТР сматрају моћним генетским маркерима у молекуларној биологији. Омогућава одлично средство за идентификацију појединаца због високог степена полиморфизма и релативно кратке дужине.

Тренутно су СТР најчешће коришћени аналитички генетски полиморфизми у форензичкој генетици. Већина форензичких случајева укључује СТР полиморфну ​​анализу. Локуси СТР су раширени по геному. Постоји на хиљаде СТР-ова смештених у хромозомима који се могу користити у форензичкој анализи. СТР анализа не укључује полиморфизам дужине рестрикције попут ВНТР анализе. СТР анализа не смањује ДНК рестрикцијским ензимима. Специфичне сонде се користе за причвршћивање жељених подручја на ДНК и помоћу ПЦР технике, одређују се дужине СТР.

Слика 02: Варијација СТР између узорака

Које су сличности између ВНТР и СТР?

• ВНТР и СТР су некодирајућа ДНК.
• Оба су тандем понављања.
• Обе показују полиморфизам код појединаца због разлике у дужини одсека ДНК.
• Обе се користе као моћни генетски маркери у штампању прста на ДНК и у форензичким студијама.

Која је разлика између ВНТР и СТР?

ВНТР вс СТР
ВНТР је некодирајућа понављајућа ДНК која има кратак нуклеотидни низ који се понавља у тандему.	СТР је јако понављајући одељак ДНК који се састоји од две до тринаест нуклеотидних понављајућих јединица које су организоване у тандему.
Величина
ВНТР су већи од СТР.	СТР-ови су мањи од ВНТР-а.
Број нуклеотида у редоследу који се понавља
Понављајућа јединица ВНТР састоји се од 10 до 100 нуклеотида.	Јединица која се понавља понавља се састоји од 2 до 13 нуклеотида.

Преглед - ВНТР вс СТР

ВНТР и СТР су два снажна генетска маркера која се користе у молекуларној биологији, посебно у области форензичке генетике. ВНТР је врста мини сателита, а СТР је микросателит. ВНТР и СТР су некодирајући, високо понављајући ДНК. То су тандем понављања. Општа структура ВНТР и СТР су исте. Међутим, број нуклеотида у редоследу који се понавља и дужина су различити. ВНТР има понављајуће секвенце које се састоје од 10 до 100 нуклеотида. СТР има понављајуће секвенце које се састоје од 2 до 13 нуклеотида. Ово је разлика између ВНТР и СТР.

Преузмите ПДФ верзију ВНТР вс СТР

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напоменама. Преузмите ПДФ верзију овде Разлика између ВНТР и СТР.

Референце:

1. „Наука о форензичкој генетици“. ЦРГ - Савет за одговорну генетику. Н.п., н.д. Веб. Доступно овде. 10. јула 2017.
2. „СТР анализа“. Википедиа. Викимедијина фондација, 22. марта 2017. Веб. Доступно овде. 10. јула 2017.

Љубазношћу слике:

1. "Д1С80Демо" написао ПалеВхалеГаил на енглеској Википедији (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа