Иако је теоријска термодинамика интеракција антиген-антитело добро позната, њихова практична примена у откривању или одређивању аутоантитела је мала. За функционална антитела одређивање оптималног афинитета омогућава постизање максималне терапијске користи. Афинитет антитела је проучаван скоро пола века, а од настанка афинитетне хроматографије пре три деценије, развио се у моћно средство. Афинитет описује интеракцију на појединачном месту везања. Познавање афинитета, као и својстава конструкта и антигена од суштинског је значаја за процену везе између афинитета и потенцијала за функционално антитело. Међутим, поред афинитета, постоји још један концепт везивања који се зове авидити, а који је укупна чврстоћа везивања интеракције између мултивалентног антигена и мултивалентног антитела. Упркос јасним разликама између њих две, термини афинитет и авидност често се употребљавају неселективно. Погледајмо ово двоје.
Афинитет је сила везивања паратопа молекула једног антитела са одговарајућим епитопом на молекулу антигена. Описује интеракцију на појединачном месту везања. Познавање афинитета, као и својстава конструкта и антигена од суштинског је значаја за процену везе између афинитета и потенцијала за функционално антитело. Заснован је на истим термодинамичким принципима који управљају било којом реверзибилном биомолекуларном интеракцијом, истом везном снагом која омогућава вашем имунолошком систему да се бори против инфекција. А снага се односи на снагу специфичне везе између антитела и његовог антигена. Прецизна и тачна процена афинитета за интеракцију антиген-антитело је важно мерило за утврђивање граница афинитета и горње границе потенцијала за терапеутско антитело. Термодинамички, афинитет се изражава као збрајање свих привлачних сила што резултира повећаном чврстоћом везивања и одбојним силама што резултира смањеном чврстоћом везивања.
Авидити је још један обавезујући концепт који се често меша са афинитетом; у ствари, оба термина се односе на концепт чврстоће везивања, осим што се авидност односи на укупну снагу антиген-везујућег капацитета смеше поликлоналних антитела. Доступност долази када се мултивалентни антиген веже на бивалентно антитело у раствору или када се антитело на површини веже за два моновалентна молекула антигена. За разлику од афинитета, авидност описује мултивалентно везивање између више места везивања лиганда, односно лигата, респективно. Једноставно речено, авидност је сила везивања између мултивалентног антитела и мултивалентног антигена. Авидност се не може описати термодинамичким изразима, а добија се кинетичким мерењима. Авидност антитела зависи од афинитета појединачних везивача антитела, али је већа од афинитета везивања јер се све интеракције антитело-антиген морају разбити истовремено да се антитело у потпуности дисоцира..
Изрази афинитет и авидност понекад се неприкладно користе као синоними. У ствари, оба термина се односе на концепт чврстоће везивања. Афинитет се у термодинамичким терминима дефинише као мерење степена повезаности између антитела и антигена, док се укупна снага која везује мултивалентно антитело за мултивалентни антиген назива авидитет или иначе позната као „функционални афинитет“. Афинитет је јачина везања антитела које комбинира место на један одговарајући епитоп антигена, док је авидност укупна снага антиген-везујућег капацитета смеше поликлоналних антитела. Поклоност се такође назива и функционални афинитет.
Израз афинитет означава константу унутрашње асоцијације између антитела и унивалентног лиганда као што је хаптен, док се термин авидитет користи за означавање укупне енергије везивања између антитела и мултивалентног антигена. Константа асоцијације је мерило афинитета антитела за епитоп. Авидност се не може описати термодинамичким изразима, а добија се кинетичким мерењима. У термодинамичком погледу, афинитет се изражава као збрајање енергије блиског распона интермолекуларних привлачних и одбојних сила између антигенске детерминанте и њеног места везивања.
Афинитет антитела може играти критичну улогу у одређивању биолошких активности антитела. Дакле, потребно је бити у могућности да карактеришете одговор антитела у смислу афинитета и величине, као и да схватите како афинитет антитела може утицати на одређени тест. Израз авидити се понекад користи синонимно са афинитетом, али најчешће се користи да опише способност антитела да формирају стабилне комплексе са антигеном. Авидитет је нагомилана снага вишеструких афинитета појединачних места везивања антитела.
Упркос њиховим разликама, често се употребљавају изрази афинитет и авидност. Афинитет је сила везивања паратопа молекуле једног антитела са одговарајућим епитопом на молекулу антигена и може се одредити само једним моновалентним Фаб фрагментом. То је зброј свих привлачних сила што резултира повећаном чврстоћом везивања и одбојним силама што резултира смањеном чврстоћом везивања. С друге стране, авидитет је сила везивања између мултивалентног антитела и мултивалентног антигена, а такође се назива и функционални афинитет. Измерјена енергија везивања између антитела и њихових одговарајућих антигена одражава авидност антитела. За разлику од афинитета, авидност се не може описати термодинамичким изразима, а добија се кинетичким мерењима.