Бактерије и вируси улазе у људско тело и умножавају се изазивајући болести. Иако се и бактеријске и вирусне инфекције разликују у зависности од погођеног органа, Кључна разлика између вирусне и бактеријске инфекције је да бактеријске инфекције повећавају број неутрофила и еозинофила, док вируси повећавају број лимфоцита. Менингитис карактерише грозница, главобоља, фотофобија, укоченост врата и збуњеност. Синуситис представља болове на лицу, температуру, цурење из носа, блокиран нос, капање носа и слуз. Упала плућа карактерише кашаљ, стварање испљувка, бол у грудима и грозница. Инфекције мокраћних путева присутна са грозницом, боловима у доњем трбуху, мокраћом обојеном крвљу и болним мокрењем.
Када бактерија или вирус уђу у организам, наилазе на заштитне механизме тела. Састаје се бела крвна зрнца, макрофаги, и дендритиц ћелије, које га захватају и пробављају. Ове бактерије и вируси садрже молекуле које су сложене рецепторе у телу идентификоване као стране материје. То покреће сложени низ реакција намењених уништавању страних супстанци. Једном када се пробави неколико првих бактерија, њихови страни протеини се прикажу на ћелијску мембрану ћелија које су их пробавиле. Ови протеини активирају Лимфоцити Б и Т. Б лимфоцити формирају антитела, а Т лимфоцити формирају отровне материје дизајниране да уништавају освајаче. Систем комплемента се активира и формира мембрану која се везује за ћелијску мембрану бактерија што доводи до његовог уништења. Када су ћелије оштећене због отровних материја које ослобађају заштитне ћелије, акутна упала започиње. Ако је организам вирулентан, уследиће велика реакција. Ако је организам упоран, апсцес може доћи до формирања и хроничне упале. Ако реакција уклони организам или лечење лековима омета природни прогрес болести, уследиће излечење резолуцијом или ожиљци.
Бактерије су једноцелијски организми. Они имају ћелијске мембране, органеле, и а језгро. Конзумирају супстрате и кисеоник и производе енергију. Они се множе да би се размножавали. То могу бити коментари, који живе у хармонији без изазивања симптома, и патогени које изазивају болести. Међу коментаторима постоје организми који узрокују болести ако се за то укаже прилика. То се назива опортунистички патогени.
Бактеријске инфекције присутне према тежини инфекције. Бактеријска инфекција резултира ослобађањем специфичних упалних медијатора. Изванстаничне бактерије покрећу миграцију неутрофили. Тако, пуна крвна слика показује високи број неутрофила. Интраћелијске бактерије покрећу еозинофиле, као и неутрофиле, и зато пуна крвна слика показује повишен број тих ћелија. Број еритроцита може бити релативно низак. Неке бактеријске болести изазивају анемију. Тромбоцит у већини случајева бројање остаје нормално.
Вируси су микроскопски облици живота са а нуклеинске киселине нит, протеин језгра и капсула. Они су једноставни организми којима је потребна ћелија да би успевала и да се размножавала. Постоје РНА вируси и ДНК вируси. ДНА вируси уграђују његов ДНК директно у ћелијски систем репликације и прави копије себе. РНА вируси производе компатибилни ланац ДНК из његове РНА уз повратну транскрипцију и уграђују га у ћелијске механизме да производе копије истог. (Прочитајте Разлика између репликације ДНК и транскрипције)
Када вируси уђу у ћелије, неки део се пробавља и страни протеини се прикажу на ћелијску мембрану ћелија домаћина. То покреће реакције тела против вируса. Лимфоцити доминирају у реакцији против вируса. Неки вируси инхибирају рад коштане сржи и ограничавају стварање ћелија. Због тога, број крвних зрнаца, број тромбоцита и број еритроцита могу да смање вирусне инфекције. Неки вируси повећавају васкуларну пропустљивост и изазивају цурење течности.
Бактерије су једноцелијски организми док су вируси примитивнији.
Бактеријске инфекције повећавају број неутрофила и еозинофила, док вируси повећавају број лимфоцита.