Тхе кључна разлика између 1Д и 2Д гел електрофорезе су својства која се користе за одвајање протеина на гел електрофорези. 1Д гел електрофореза раздваја само протеине на основу молекулске тежине док 2Д гел електрофореза одваја протеине на основу његове изоелектричне тачке и молекуларне тежине.
Одвајање протеина гел електрофорезом је важна техника за карактерисање протеина. Протеини имају различита својства; према томе, одвајање је сложеније у поређењу са одвајањем ДНК електрофорезом гела Агаросе.
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је 1Д гел електрофореза
3. Шта је 2Д гел електрофореза
4. Сличности између 1Д и 2Д гел електрофорезе
5. Упоредна упоредба - 1Д вс 2Д гел електрофореза у табеларном облику
6. Резиме
1Д гел електрофореза, позната и као једно димензионална гел електрофореза, је метода одвајања протеина заснована на молекуларној тежини. Одвајање протеина углавном се одвија електрофорезом полиакриламидног гела. На основу концепта гел електрофорезе, молекули се одвајају по својству молекуларне тежине и наелектрисања.
Због тога, да би се протеинима уједначио, третман натријум-додецил-сулфатом (СДС) се обавља пре гел електрофорезе. СДС денатура протеине и обезбеђује једноличан негативан набој протеина; када се примењује електрично поље, протеини прелазе на позитиван терминал на основу њихове молекуларне тежине. Тако се раздвајањем сматра само једно својство. Због тога се ова метода назива 1Д гел електрофореза.
Слика 01: 1Д гел електрофореза
Током 1Д гефоре електрофорезе протеини се одвајају на основу њихове молекуларне тежине. С тим у вези, молекули мање тежине мигрирају брже у гелу у поређењу са протеинима велике молекуларне тежине. Дакле, протеини велике тежине остају у близини извора.
2Д гел електрофореза или дводимензионална гел електрофореза раздваја протеине на основу два својства. Две особине су изоелектрична тачка протеина и молекуларна тежина. Ова метода раздвајања протеина повећава резолуцију одвајања протеина. Изоелектрична тачка протеина зависи од пХ при коме је протеин неутралан.
Слика 02: 2Д гел електрофореза
На тај начин, у 2Д гел електрофорези, протеин се пушта са фиксним градијентом пХ у првој димензији. У другој димензији, протеини су раздвојени вертикалном или хоризонталном електрофорезом полиакриламидног гела. Тако се протеини одвајају према својој молекуларној тежини у другој димензији.
Поред тога, ова метода електрофорезе гела повећава резолуцију одвајања протеина. Због тога су раздвојени протеини чистији. Међутим, цена технике много је већа од геословне електрофорезе у једној димензији.
Кључна разлика између 1Д и 2Д гел електрофорезе је да 1Д гел електрофореза раздваја протеине на основу молекулске тежине, док 2Д гел електрофореза раздваја протеине на основу изоелектричне тачке и молекуларне тежине. Због ове основне разлике између 1Д и 2Д гел електрофорезе, резолуција одвајања протеина и цена ове две технике такође варирају. 2Д гел електрофореза показује већу резолуцију у односу на 1Д гел електрофорезу. Међутим, 2Д гел електрофореза је скупља од 1Д гел електрофорезе.
Испод инфографике је приказана разлика између 1Д и 2Д гел електрофорезе.
Одвајање протеина зависи од многих фактора. 1Д гел електрофореза одваја протеине на основу молекулске тежине. Међутим, дводимензионална или 2Д гел електрофореза повећава резолуцију одвајања протеина. Надаље, 2Д гел електрофореза раздваја протеине на основу изоелектричне тачке и молекуларне тежине. Стога су ови подаци важни за даљу обраду протеина и у области протеомике. Дакле, ово је резиме разлика између 1Д и 2Д гел електрофорезе.
1. Галева, Надежда и МицхаилАлтерманн. „Поређење једнодимензионалне и дводимензионалне гел електрофорезе као алата за раздвајање протеомске анализе микросома јетре штакора: Цитохроми П450 и други мембрански протеини.“ Протеомицс, америчка Национална медицинска библиотека, јун 2002, доступно овде.
1. „Електрофореза - пуњење 1Д геластих јажица мешавинама протеина“ Јеан-Етиенне Поирриер - Пуњење 1Д геленских јажица мешавинама протеина (ЦЦ БИ-СА 2.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. „2Д електрофореза“ Националног института за здравље - Центар за нанобиологију за истраживање рака, Национални институт за здравље (Публиц Домаин) преко Цоммонс Викимедиа