Разлика између бензоназе и ДНазе

Кључна разлика - Бензоназа против ДНасе
 

Разградња нуклеинских киселина је важна за многе технике молекуларне биологије. Широко се користи у рекомбинантној ДНК технологији да би се решили нежељени фрагменти ДНК и РНК. Ензими који разграђују нуклеинску киселину називају се Нуцлеасес, а могу бити различитог типа на основу тражене функције. Нуклеазе које разграђују ДНК познате су као ДНазе док су оне које разграђују РНК познате као РНазе. Ови ензими се углавном користе у ин витро експерименти где ин витро врше се молекуларни тестови да се изолује чиста ДНК, РНА или протеини. Бензоназе су врста нуклеуса које разграђују и ДНК и РНК док ДНазе деградирају само ДНК. Ово је кључна разлика између бензоназе и ДНасе.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је бензоназа
3. Шта је ДНаза
4. Сличности између бензоназе и ДНазе
5. Упоредно упоређивање - Бензоназа вс ДНасе у табеларном облику
6. Резиме

Шта је Бензоназа?

Бензоназа је генетски инжењерска ендонуклеаза из Серратиа марцесценс. Овај ензим се производи у Е. цоли домаћини у индустријском обиму. Бензоназа је способна да цепа дволанчану ДНК, линеарну ДНК, кружну ДНК и једноланчану РНК. Стога је Бензоназа комерцијално важна. Ензим Бензоназа је протеински димер који има 245 идентичних аминокиселина, ~ 30 кДа подјединица са две есенцијалне дисулфидне везе. Бензоназа цепа нуклеинске киселине на свом крају од 5 'и ствара фрагменте са слободним 5'-крајима. Бензоназа може да цепа нуклеинске киселине у било ком редоследу, али преферира ГЦ регионе богате.

Бензоназа се чува на -20 ⁰Ц. Нађено је да је оптимални пХ за активност ензима 8,0 - 9,2. Примене Бензоназе укључују припрему узорка за електрофорезу протеина 2Д, где Бензоназа уклања везане нуклеинске киселине и уклањање контаминаната нуклеинских киселина из рекомбинантних протеинских препарата. Такође се користи за смањење вискозности протеинских екстраката и спречава накупљање ћелија у ћелијској смеши.

Шта је ДНаза?

ДНаза је нуклеарни хидролатни ензим који је способан само да цепа дволанчане ДНК. Постоје две главне врсте ДНаза: ДНаза И и ДНаза ИИ. ДНаза И учествује у цепању дволанчане ДНК да би се добили полинуклеотиди са 5 'слободним крајевима. ДНасе ИИ је укључена у цепање дволанчане ДНК за производњу полинуклеотидних ланаца са 3 'слободним крајевима или надвратницима.

ДНасе И

ДНасе И функционише на оптималном пХ између 7,0 - 8,0. Активност ензима зависи од многих јонских кофактора који укључују, Ца²⁺, Мг²⁺ или Мн²⁺. Делатност Мг²⁺ и Мн²⁺ одлучује о функцији ДНазе И. У присуству Мг²⁺, ДНаза независно разреже сваки низ дсДНА. Ово се одвија насумично. Супротно томе, у присуству Мн^2+, ензим цепа обе ланце ДНК на приближно истом месту. Ово цепање ће резултирати производњом две врсте фрагмената ДНК; један тип са тупим крајевима и други тип са једним или два нуклеотидна прегиба.

Слика 02: ДНаза

ДНасе ИИ

Функције ДНасе ИИ при оптималном пХ од 4,5-5,0 и двовалентни јони метала потребни су за његову активност, слично као ДНасе И. Механизам ДНасе ИИ састоји се од три главна корака.

1. У ДНК краљежници се индуцирају више једноструких ломова.
2. Производе се у киселини растворљиви нуклеотиди и олигонуклеотиди.
3. Нелинеарни хиперхромни помак догађа се у последњој фази.

Главни инхибитори ензима ДНасе укључују хелаторе метала, прелазне метале и хемикалије попут натријум-додецил сулфата и β - меркаптоетанола..

Главне примјене ДНасе укључују припрему РНА екстраката без протеина ДНА и екстракте протеина и уклањање шаблонске ДНК током експеримената ин витро транскрипције..

Које су сличности између Бензоназе и ДНасе?

• Оба су хидролатни ензими.
• Обоје су недостаци.
• Обоје учествује цепањем фосфодиестерских веза нуклеинских киселина.
• Обоје захтевају оптималну пХ и температуру складиштења да би се одржала активност ензима.
• Инхибитори ензима укључују хелатне агенсе, прелазне метале и хемикалије детерџента.
• Апликације су углавном усмерене на добијање екстраката високе чистоће ДНК, РНА и протеина.
• Оба ензима могу се произвести генетским инжењерингом.

Која је разлика између бензоназе и ДНазе?

Бензонасе вс ДНасе
Бензоназа је ензим који је способан да цепа дволанчану ДНК, линеарну ДНК, кружну ДНК и РНК.	ДНаза је ензим који је способан да цепа дволанчане ДНК.
Супстрат за ензим
И ДНК и РНА су супстрати за бензоназу.	ДНК је супстрат за ДНазу.
Структура
Оптимални опсег пХ Бензоназе је 7,0 -8,0	Оптимални опсег пХ ДНазе И је 7,0 - 8,0, а ДНазе ИИ 4,5 - 5,0.

Преглед - Бензоназа вс ДНасе

Ензими нуклеазе се широко користе у различитим експерименталним поступцима у погледу молекуларне биологије и генетског инжењеринга. Бензоназа и ДНасе су две врсте нуклеаза. Бензоназа је укључена у разградњу и ДНК и РНК док је ДНасе укључена у цепање дволанчане ДНК. Ово је основна разлика између бензоназе и ДНазе. Тренутно су оба ова типа нуклеазе произведена помоћу рекомбинантне ДНК технологије која даје ензиме вишег квалитета који су оптимизовани за максималну производњу.

Преузмите ПДФ верзију Бензонасе вс ДНасе

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде. Разлика између бензоназе и ДНасе

Референце:

1. „Деоксирибонуклус И из говеђег панкреаса Д5025.“ Сигма-Алдрицх, доступно овде. Приступљено 19. септембра 2017.
2. „Деоксирибонуклус ИИ.“ Деокирибонуцлеасе ИИ - Приручник за ензим Вортхингтон, доступан овде. Приступљено 19. септембра 2017.

Љубазношћу слике:

1. "Преосјетљиво мјесто на ДНК" Ванг И-М, Зхоу П, Ванг Л-И, Ли З-Х, Зханг И-Н, ет ал. - Ванг И-М, Зхоу П, Ванг Л-И, Ли З-Х, Зханг И-Н, ет ал. (2012) Корелација између дистрибуције хиперсензитивног места ДНасе И и експресије гена у ћелијама ХеЛа С3. ПЛОШЕ ЈЕДАН 7 (8): е42414. дои: 10.1371 / јоурнал.поне.0042414 (ЦЦ БИ-СА 2.5) виа Цоммонс Викимедиа