Разлика између ЦРИСПР и РНАи

Кључ Разлика - ЦРИСПР вс РНАи
 

Уређивање генома и модификација гена долазе у области интереса генетике и молекуларне биологије. Модификација гена је широко применљива за студије генске терапије, а такође се користи да идентификује својства гена, функционалност гена и како мутације у гену могу утицати на његову функцију. Важно је развити ефикасне и поуздане начине да се изврше прецизне, циљане промене у геному живих ћелија. Технике попут ЦРИСПР и РНАи користе се за модификовање гена с великом прецизношћу. ЦРИСПР или редовно кластерирани кратки паиндромски понављачи су природни прокариотски имунолошки одбрамбени механизам који се у последње време користи за уређивање и модификацију еукариотских гена. РНАи или РНА интерференција је специфична метода за секвенцу како би се утишали гени увођењем мале дволанчане РНА која посредује нуклеинским киселинама и регулише експресију гена. Ово је кључна разлика између ЦРИСПР-а и РНАи.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је ЦРИСПР
3. Шта је РНАи
4. Сличности између ЦРИСПР-а и РНАи-а
5. Упоредна упоредба - ЦРИСПР против РНАи у табеларном облику
6. Резиме

Шта је ЦРИСПР?

ЦРИСПР систем је природни механизам присутан у неким бактеријама, укључујући Е. цоли и археје. Ради се о адаптивној имуној заштити од страних инвазија заснованих на ДНК. То је механизам специфичан за секвенцу. ЦРИСПР систем садржи неколико елемената понављања ДНК. Ови елементи су испреплетени кратким "размакнутим" низовима који су изведени из страних ДНК и вишеструких Цас гена. Неки од Цас гена су нуклеазе. Стога се целокупни имуни систем назива ЦРИСПР / Цас систем.

Слика 01: ЦРИСПР / Цас систем

Тхе ЦРИСПР / Цас систем функционише у четири корака.

1. Систем генетски везује инвазивне сегменте фага и плазмидне ДНК (размаке) у ЦРИСПР локусе (зване корак аквизиције одстојника).
2. Корак сазревања црРНА - Домаћин транскрибира и обрађује ЦРИСПР локусе за генерисање зреле ЦРИСПР РНА (црРНА) који садржи и ЦРИСПР поновне елементе и интегрисане размакне елементе.
3. Детекција црРНА - Ово је омогућено комплементарним основним упаривањем. Ово је важно када је присутна инфекција и постоји инфективни узрочник.
4. Циљани корак интерференције - црРНА открива страну ДНК, формира комплекс са страном ДНК и штити домаћина од стране ДНК.

Тренутно се ЦРИСПР / Цас систем користи за промену или модификацију генома сисара било репресијом транскрипције или активацијом. Ћелије сисара могу да одговоре на прекиде ДНК посредоване ЦРИСПР / Цас9 усвајањем механизма поправке. Може се обавити коришћењем нехомологне методе крајњег спајања (НХЕЈ) или санације усмерене на хомологију (ХДР). Оба ова механизма за поправак се одвијају увођењем двоструких набоја. Ово резултира уређивањем гена сисара. Тако се тренутно ЦРИСПР / Цас систем користи у областима терапеутске, биомедицинске, пољопривредне и истраживачке примене.

Шта је РНАи?

РНА интерференција је дволанчана техника посредована РНА, која се користи за регулисање експресије гена. Главно укључено једињење су мале интерферирајуће РНК (сиРНА). СиРНА су посебна врста дволанчаних РНА са 3 'прекомерним слојем два нуклеотида и 5' фосфатном групом. РНА-индуковани утишавајући комплекс (РИСЦ) формиран је током РНА интерференције која би резултирала деградацијом гена везаног за сиРНА.

Слика 02: РНАи

Процедура РНАи је следећа.

1. Дволанчана РНА ће се прерадити у цитоплазми помоћу РНасе ИИИ типа ендорибонуклеазе зване Дицер да би се генерисало ~ 21 нуклеотидне дуге сиРНА
2. Пренос сироке везане Дицер у Аргонауте, уз помоћ дволанчаних РНА везујућих протеина (дсРНАБП).
3. Везивање Аргонауте-а на један дуплекс (водећи прамен). Ово ће избацити други прамен. То резултира читавим комплексом протеина - РНА који се зове РИСЦ.
4. Упаривање РИСЦ комплекса са једноструким водичем РНА везаном за Аргонауте.
5. Упаривање циља хомологне РНА са водичем РНА.
6. Активација Аргонаутеа резултира деградацијом циљне РНА

Каква је сличност између ЦРИСПР-а и РНАи-а?

• Оба се користе као истраживачки алати за модификацију експресије гена

Која је разлика између ЦРИСПР-а и РНАи-а?

ЦРИСПР вс РНАи
ЦРИСПР је имунолошки одбрамбени механизам који се у последње време користи за уређивање и модификацију еукариотских гена.	РНАи је метода специфична за секвенцу како би се утишали гени увођењем малих дволанчаних гена
Циљана секвенца
Синтетичка РНА (водич РНА) је циљна секвенца ЦРИСПР.	сиРНА је циљна секвенца РНАи.
Ефикасност у сузбијању гена
Низак ниво ЦРИСПР	Висока у РНАи
Ефекти
Срушавање гена се јавља у ЦРИСПР.	У РНАи долази до нокаута / утишања.

Преглед - ЦРИСПР вс РНАи

ЦРИСПР или Редовито кластерирана понављајућа кратка палиндромска понављања је прокариотски имуно-одбрамбени одбрамбени механизам који се у последње време користи за уређивање и модификацију еукариотских гена. РНАи или РНА интерференција је секвенцијално специфична метода за утишавање гена увођењем мале дволанчане РНА која посредује нуклеинским киселинама и регулише експресију гена. Ово се може узети као основна разлика између ЦРИСПР и РНАи. Обе технике, ЦРИСПР / Цас и РНАи, су снажни алати за манипулацију генима иако је ЦРИСПР / Цас сигурно супериорнији од РНАи јер се може користити за индукцију убацивања и брисања. Специфичност је такође висока у систему ЦРИСПР / Цас.

Преузмите ПДФ верзију ЦРИСПР-а против РНАи

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде Разлика између ЦРИСПР-а и РНАи-а 

Референце:

1.Биолабс, Нова Енглеска. „ЦРИСПР / Цас9 и Уређивање циљаног генома: Ново доба у молекуларној биологији.“ ЦРИСПР / Цас9 и Уређивање циљаног генома: ново доба у молекуларној биологији | НЕБ. Приступљено 22. септембра 2017. Доступно овде 
2. "РНА интерференција (РНАи)." Национални центар за биотехнолошке информације, Америчка национална медицинска библиотека. Приступљено 22. септембра 2017. Доступно овде
3.Уннииампуратх, Унникрисхнан и др. „Мешање РНА у доба ЦРИСПР-а: Хоће ли се ЦРИСПР умешати у РНАи?“ Међународни часопис за молекуларне науке, МДПИ, мар. 2016. Приступљено 22. септембра 2017. Доступно овде

Љубазношћу слике:

1. 'Фазе имунитета за ЦРИСПР' ЦтСкеннертон - сопствени рад, (ЦЦ БИ-СА 4.0) преко Цоммонс Викимедиа 
2.'РНАи-поједностављено '. Ову фигуру је прилагодио Матзке МА, Матзке АЈМ - Ову цифру је прилагодио Матзке МА, Матзке АЈМ (2004) Садња семена нове парадигме. ПЛоС Биол 2 (5). (ЦЦ БИ 2.5) преко Цоммонс Викимедиа