Разлика између секвенце Екоме и РНА

Кључна разлика - секвенција Екоме вс РНА
 

Секвенцирање нуклеинске киселине је техника којом се одређује редослед нуклеотида у одређеном фрагменту ДНК или РНК организма. Секвенцирање је важно за идентификацију састава ДНК и РНК ћелије и разликовање одређених гена који кодирају функционалне протеине; стога секвенце могу користити за разумевање мутација ових гена и експресије гена. Сангер Секуистинг метода или напредније методе секвенцирања следеће генерације су методе секвенцирања које се обично користе. Екоме секвенцирање је секвенционирање комплетног низа егзона или кодирајућих ДНК региона присутних у организму док је РНА секвенцирање поступак секвенцирања рибонуклеинских киселина (РНА). Ово је кључна разлика између егзеоме и РНА секвенце.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је издвајање секвенце
3. Шта је РНА секвенција
4. Сличности између секвенце Екоме и РНА
5. Упоредно упоређивање - Секоменирање Екоме вс РНА у табеларном облику
6. Резиме

Шта је издвајање секвенце?

Екоме је подскуп гена који се састоји од кодирајућих гена одређеног организма. Гени за кодирање су именовани као егзони и транскрибирају се у мРНА и затим се преводе у аминокиселинске секвенце. Током пост транскрипцијских модификација, механизам спајања РНА у еукариотама уклања интроне (некодирајућа подручја), а егзони остају. Постоје две главне технике у којима се врши секвенцирање егоме: решење засновано на низу.

У секвенцирању егзоме заснованог на раствору, ДНК узорци су фрагментирани помоћу рестрикционих ензима или механичким поступком и денатурирани топлином. У овој техници, биотинилиране олигонуклеотидне сонде (мамци) користе се за селективну хибридизацију са циљаним регионима у геному. За корак везања користе се магнетне стрептавидинске куглице. Након везивања следи корак прања где се невезани и нециљани низови исперу. Повезани циљеви се затим ампликују употребом ланчане реакције полимеразом (ПЦР), а затим се секвенционишу коришћењем Сангер секвенцирања или технике секвенционирања следеће генерације..

Слика 01: Одређивање секвенци

Метода заснована на матрици је такође слична методи заснованој на раствору, само што се фрагменти ДНК ухватају у микро-низ, а затим следе кораци везивања и прања пре него што се секвенционишу.

Екоме секвенцирање користи се у многим апликацијама као што су генетска дијагностика болести, у генској терапији, у идентификовању нових генетских маркера, у пољопривреди за идентификацију различитих корисних агрономских карактеристика и у поступцима узгоја биљака..

Шта је РНА секвенција?

Редослед РНА заснован је на транскрипту, који је цео транскрипт ћелије. Кључни циљеви секвенце РНА су каталогизирање свих врста транскрипта, укључујући мРНА, некодирајућу РНК и малу РНА, за одређивање транскрипцијске структуре гена и квантификацију нивоа експресије сваког транскрипта током развоја. Током РНА секвенце, у почетку су коришћене хибридизационе технологије (које су комплементарне ДНК изведене из зрелих секвенци мРНА). Тренутно се за секвенцирање РНА користи тачнија и напреднија техника додавања.

Слика 02: Редослед РНА

У секвенцирању РНА, узорак РНА који може бити укупна РНА или фракционисана РНА претвара се у њену комплементарну ДНК (цДНА) коришћењем реверзне транскрипције и припрема се библиотека цДНА. Сваки фрагмент цДНА је везан за адаптере са обе стране (парно завршавање секвенце) или на једној страни (једнокрако секвенционирање). Ове обележене секвенце секвенционирају се употребом Сангер секвенцирања или следеће генерације, попут секвенци екоме.

Које су сличности између секвенце Екоме и РНА?

• Кратки одабрани фрагменти или цео сет ДНК / РНА могу се користити за секвенцу Екоме или РНА.
• Слиједни фрагменти су сачувани у библиотекама.
• Може се користити сигурније секвенцирање или следеће генерације.
• Обоје су ин витро методе секвенцирања.
• Секвенцијални фрагменти могу се одредити флуоресцентним ознакама.

Која је разлика између секвенце Екоме и РНА?

Екоме вс РНА Секуистинг
Екоме секвенционирање је секвенционирање комплетног низа егзона или кодирајућих ДНК региона присутних у организму.	РНА секвенцирање се односи на поступак секвенцирања рибонуклеинске киселине (РНА); транскрипт.
Покретање узорка
Геномска ДНК је почетни узорак секвенце егзома.	РНА је почетни узорак секвенце РНА.
Састав
Ово садржи само кодирајуће области целокупне ДНК познате као Еконс	Садржи РНА-мРНА / транскрипт.
Секвенцирање
Постоје две главне методе секвенцирања егза; технологије засноване на решењима и низу.	Секвенцирање РНК се обавља препарацијом библиотеке цДНА екстракцијом укупне РНК или фрагментиране РНА.

Преглед - Редослед Екоме вс РНА

Екоме је комплетан сет кодирајућих подручја организма, а технике које су укључене у одређивање тачног нуклеотидног реда Екоме-а познате су и као секвенцирање екоме-а. Секвенцирање РНК је техника која је укључена у одређивање нуклеотидног реда РНА у организму. Ово је разлика између секвенце екоме и РНА.

Преузмите ПДФ верзију секвенце Екоме вс РНА

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде. Разлика између секвенце Екоме и РНА

Референце:

1.Ванг, Зхонг и др. "РНА-Сек: револуционарно средство за транскриптомију." Натуре ревиевс. Генетицс, Америчка национална медицинска библиотека, јануар 2009, доступно овде. Приступљено 3. септембра 2017.
2.Варр, Аманда и др. „Поредање у низу: тренутне и будуће перспективе“. Г3: Гени | Геноми | Генетика, Генетичко друштво Америке, август 2015., доступно овде. Приступљено 3. септембра 2017.

Љубазношћу слике:

1. "Екоме Секуистинг Воркфлов 1а" Малацхи Гриффитх, Јасон Р. Валкер, Ницхолас Ц. Спиес, Бењамин Ј. Аинсцоугх, Оби Л. Гриффитх - (ЦЦ БИ 2.5) виа Цоммонс Викимедиа
2. "Јоурнал.пцби.1004393.г002" написао СарахКусала - Властити рад (ЦЦ БИ 3.0) преко Цоммонс Викимедиа