Ген садржи кодирајуће и некодирајуће регије унутар њега. Секвенце кодирања су познате као егзони, а некодирајуће секвенце су познате као интрони. Нуклеотидна секвенца егзона гена представља генетски код гена за синтезу специфичног протеина. Отуда, егзони остају у молекули мРНА. Укупна егзонова регија генома позната је као егзом и важан је дио генома. Генетски код гена претвара се у генетски код молекула мРНА, који је потребан за производњу протеина. Цео молекул мРНА транскрибиран у ћелију или ћелијску популацију у исто време познат је као транскрипт. Кључна разлика између егзома и транскрипта је та екоме представља секвенце егзонских области генома док транскрипт представља укупну мРНА ћелије или ткива у датом тренутку.
САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је Екоме
3. Шта је транскрипт
4. Упоредна упоредба - Екоме вс Трансцриптоме
5. Резиме
Гени су сачињени од егзона, интрона и регулаторних низова. Егзони су генске регије које се током транскрипције преписују у мРНА секвенцу. Интрони и остали некодирајући региони уклањају се током транскрипције. Нуклеотидна секвенца егзона одређује генетски код гена који синтетише специфични протеин који он кодира. Само ексони остају унутар мРНА протеина. Колекција егсона у геному позната је као егзо организма. Представља део генома који је изражен генима. Код људи егзоме чини 1% од генома. То је део који кодира протеин у људском геному.
Слика 01: Екоме
Транскрипт је колекција свих транскрипта који кодирају протеине и некодирајуће ткиво (РНА) у датом ткиву. Транскрипт представља скуп укупних молекула мРНА изражених генима у ћелији или ткиву. Транскрипт ћелије може да се варира са транскриптом другог типа ћелија. Транскрипт је такође динамичан - мења се с временом као одговор на унутрашње и спољашње подражаје. Чак и унутар истог ткива или унутар исте врсте ћелија, транскрипт се може променити након неколико минута.
Транскрипт се разликује од екоме организма. Транскрипт укључује само експримиране ексоме секвенце. Иако егзоти ћелије остају исти, транскрипт се разликује међу ћелијама јер експресија гена није иста за све ћелије или ткива. Само се битни гени експримирају у различитим ћелијама и ткивима. Експресија гена је специфичан процес ткива или ћелија. Регулисано је различитим факторима укључујући факторе из окружења. Стога транскрипт може варирати у зависности од спољних услова околине.
Транскрипт се користи као прекурсор за студије протеомике. Сви протеини су изведени из мРНА секвенце. Транслационе модификације могу резултирати променама протеина. Међутим, транскрипт даје важне основне информације за протеомске студије.
Слика 02: Транскрипт матичних ћелија ембриона
Екоме вс Трансцриптоме | |
Екоме је колекција протеина који кодира протеин. | Транскрипт је збирка свих преписаних РНА, укључујући мРНА. |
Узорак | |
Екоме се проучава коришћењем ДНК узорка. | Транскрипт се проучава помоћу РНА узорка. |
Метода студије | |
Редослед проучавања екоме-а је метода проучавања екоме-а. | Редослед РНА је метода проучавања транскрипта. |
Егзони су кодирајуће секвенце гена и одређују мРНА секвенце протеина. Колекција ових кодирајућих низова (егзона) позната је као егзота организма. Гени се преписују у молекуле мРНА пре стварања протеина. Укупни молекули мРНА ћелије или ткива у било којем тренутку познати су као транскриптом. Транскрипт представља гене који се активно експримирају у мРНА у било којем тренутку. Транскрипт је специфичан за ћелије и ткива и утиче на услове животне средине. Ово је разлика између егзома и транскрипта.
Референце:
1. Сарах и остали, „Циљано хватање и масовно паралелно секвенционирање дванаест људских прихода“. Природа. Америчка национална медицинска библиотека, 10. септембра 2009. Веб. 01. април 2017
2.Мутз ет ал. „Транскриптна анализа коришћењем следеће генерације.“ Елсевиер: Локатор чланака. Н.п., септембар 2012. Веб. 01. април 2017
Љубазношћу слике:
1. "Транскрипт плурипотентних ћелија" Грсковиц, М. и Рамалхо-Сантос, М., Плокрипотентни транскрипт (10. октобар 2008), СтемБоок, ед. Заједница за истраживање матичних ћелија, СтемБоок, дои / 10.3824 / матична књига.1.24.1, хттп://ввв.стембоок.орг. - [1] ДирецтСтемБоок Слика 2 Транскрипт плурипотентних ћелија. Гршковић, М. и Рамалхо-Сантос, М., Плокрипотентни транскрипт (10. октобар 2008.), СтемБоок, ед. Заједница за истраживање матичних ћелија, СтемБоок, дои / 10.3824 / матична књига.1.24.1, (ЦЦ БИ 3.0) преко Цоммонс Викимедиа