Разлика између Мицроарраи и Секвенце нове генерације

Кључна разлика - Мицроарраи вс Секвенција следеће генерације
 

Поступци секвенцирања ДНК широко се користе у областима биотехнологије, вирологије, медицинске дијагнозе и судске медицине. То је поступак који одређује тачан редослед нуклеотида, аденина, гванина, тимина и цитозина присутних у молекули ДНК. Поступци секвенцирања ДНК постали су убрзање чудесних открића у медицинским и биолошким истраживањима. Ове секвенце су еволуирале до секвенцирања комплетног генома појединих организама, укључујући људе и друге живе врсте. Микрорачуни и секвенција нове генерације су савремени поступци секвенцирања ДНК. Мицроарраи техника се посебно заснива на хибридизацији која садржи скуп познатих циљева. Редослед следеће генерације заснован је на синтези (која користи ДНК полимеразу да би се уградили нуклеотиди) и има могућност секвенцирања целог генома независно од претходно изабраних мета. Ово је кључна разлика између Мицроарраи и Секвенце нове генерације.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је Мицроарраи 
3. Шта је секвенционирање нове генерације
4. Сличности између Мицроарраи и Секвенце нове генерације
5. Упоредно упоређивање - Мицроарраи вс Секвенција следеће генерације у табеларном облику
6. Резиме

Шта је Мицроарраи?

ДНК микроарраи се користи као лабораторијски алат како би се истовремено идентификовало хиљаде различитих генских експресија. То је чврста површина, тј. Тобоган за микроскоп, који садржи збирку микроскопских ДНК флека исписаних на њему. Свака штампана тачка садржи познату секвенцу гена или ген. Ове познате сонде штампане на дијапозитиву служе као сонде за детекцију експресије гена. То је познато као транскрипт. Хибридизација између два ланца ДНК је основни принцип на којем се заснивају микрорачуни. То је комплементарно базно упаривање нуклеинских киселинских секвенци са формирањем водоничних веза.

Слика 01: Мицроарраи

У почетку се молекуле мРНА сакупљају из експерименталног узорка и референтног узорка добијеног од здраве јединке. Експериментални узорци се добијају од оболелих јединки; на пример, појединац који болује од рака. Једном добијени, оба узорка мРНА се претварају у цДНА (комплементарна ДНК). Затим се сваки узорак обележи помоћу флуоресцентне сонде. Флуоресцентне сонде су различитих боја како би се разликовала узорак цДНА од референтне цДНА. Да би се иницирало везивање молекула цДНА на слајду микрорачуна, два узорка се мешају заједно. Хибридизација је процес којим се молекули цДНА вежу за ДНК пробе на дијапозитиву микрорачуна. Једном када је хибридизација завршена, одвија се низ реакција у циљу идентификације и мерења експресије сваког гена са појавом различитих боја према количини гена који је изражен. Резултати микрорачуна користе се у стварању профила експресије гена који се може користити за идентификацију различитих стања болести.

Шта је секвенционирање нове генерације?

Следећа генерација секвенцирања (НГС) је напредна метода генетског секвенцирања. Његов принцип је сличан принципу Сангер Секвенце, што зависи од капиларне електрофорезе. У НГС-у, генски ланац је фрагментиран и везан на шаблонски низ. Основе сваког ланца су идентификоване по одабраним сигналима током његовог процеса лигације. У методи Сангер секвенцирања укључена су три одвојена корака, секвенцирање, одвајање и детекција. Због ових засебних корака, аутоматизација припреме узорка је ограничена у протоку. У НГС, техника је развијена коришћењем низања заснованог на низу са комбинацијом корака Сангер-овог поступка секвенцирања што може довести до тога да се милиони реакционих серија истовремено спроводе паралелно; то доводи до велике брзине и пропусности уз ниску цену.

Слика 02: Развој НГС-а

НГС се састоји од три корака; припрема библиотеке (стварање библиотека уз коришћење случајне фрагментације ДНК), амплификација (амплификација библиотеке коришћењем клонског амплификације и ПЦР) и секвенционирање. Поступци секвенцирања генома који се изводе током екстремно дугог трајања користећи Сангер поступак секвенцирања могу се завршити за неколико сати употребом НГС.

Која је сличност између Мицроарраи и Секвенце нове генерације?

• И Мицроарраи и Секвенција следеће генерације су развијене коришћењем низања заснованог на низу.

Која је разлика између Мицроарраи и Секвенце нове генерације?

Мицроарраи вс Секвенција следеће генерације
Мицроарраи је колекција микроскопских ДНК спотова причвршћених на чврсту површину, која се користи за мерење нивоа експресије великог броја гена истовремено.	НГС (Сљедећа генерација секвенцирања) је технологија са слијеђењем ДНК са високом пропусношћу која није заснована на Сангер-у и омогућава паралелно секвенционирање милиона или милијарди ДНК ланаца.
Интеракције са антигеном
Мицроарраи се заснива на хибридизацији која је састављена од скупа познатих циљева.	НГС је заснован на синтези која користи ДНК полимеразу за укључивање нуклеотида и не зависи од претходно изабраних циљева.

Преглед - Мицроарраи вс Секвенција следеће генерације

У контексту истраживања, секвенцирање ДНК постало је важан убрзавач. Широко се користи у биотехнологији, медицинској дијагнози и форензичким студијама. Развио се и развио у ефикасније и брже поступке секвенцирања. Мицроарраис и НГС су две напредне технике секвенцирања ДНК. Обоје су развијени коришћењем низања заснованог на низу. Микроарраи техника се ослања на хибридизацију док се НГС заснива на синтези, која користи ДНК полимеразу за укључивање нуклеотида. Ово је главна разлика између Мицроарраи и Секвенце нове генерације.

Преузмите ПДФ верзију Мицроарраи-а против Секвенце нове генерације

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде. Разлика између Мицроарраи-а и Секвенце нове генерације

Референце:

1.Бехјати, Сам и Патрицк С Тарпеи. „Шта је следећа генерација?“ Архива болести у детињству. Образовање и пракса издања, БМЈ Публисхинг Гроуп, децембар 2013., доступно овде. Приступљено 23. августа 2017
2. Бумгарнер, Рогер. „Преглед ДНК микрорачуна.“ Тренутни протоколи из молекуларне биологије, Јохн Вилеи анд Сонс Инц., 9. фебруара 2016., доступни овде. Приступљено 23. августа 2017.
3. „ДНА Мицроарраи Тецхнологи“. Национални институт за истраживање људског генома (НХГРИ), доступан овде. Приступљено 23. августа 2017.

Љубазношћу слике:

1. "ДНК микрорачун" Гуиллауме Паумиер (корисник: гуиллом) - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. „Развој у секвенцији нове генерације“ Недербрагт, Лек (2012) - (ЦЦ БИ 3.0) преко Цоммонс Викимедиа