Разлика између случајних примера и Олиго дТ

Тхе кључна разлика између случајних прајмера и олиго дТ је то случајни прајмер је мешавина свих могућих хексамер олигонуклеотидних секвенци, док се олиго дТ прајмер састоји од једноланчаног дијела 12-18 деокситимидина.

Реверзна транскрипција је механизам у којем цДНА може да се синтетише користећи мРНА или било коју врсту РНА. Да би се произвела цДНА, треба обезбедити ензим за реверзну транскриптазу и остале неопходне компоненте, посебно образац и прајмер. Примери су кратке ДНК секвенце посебно дизајниране за амплификацију циљних секвенци. Насумични прајмери ​​и олиго дТ прајмери ​​су две уобичајене врсте прајмера који се користе у обрнутој транскрипцији. Због тога, насумични прајмер или олиго дТ прајмер су кратке ДНК олигонуклеотидне секвенце потребне да се реверзни транскриптаза започне повратна транскрипција. У зависности од узорка РНА, од ове две врсте прајмера може се изабрати одговарајући прајмер.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта су случајни прајмери 
3. Шта је Олиго дТ
4. Сличности између случајних примера и Олиго дТ
5. Упоредно упоређивање - насумични прајмери ​​против Олиго дТ у табеларном облику
6. Резиме

Шта су случајни прајмери?

Насумични прајмер је мешавина олигонуклеотида који представљају све могуће секвенце хексамера. Редослед прајмера случајног прајмера је 5 '- д (НННННН) -3' Н = Г, А, Т или Ц. Стога се насумични прајмери ​​могу користити за амплификацију једноланчане ДНК или РНК ДНК полимеразом или реверзном транскриптазом, редом. Поред тога, случајна прајмер смеша је способна да ампликује све регионе РНА да би створила цДНА. Тако се ствара цДНА различите дужине.

Слика 01: Случајни прајмери

Најважније је да случајна смеша не показује специфичност шаблона. Није у стању да разликује мРНА и друге РНК врсте. А испере се са било којом врстом РНА у узорку. Међутим, случајна прајмер смеша је погодна за реверзну транскрипцију РНА без поли (А) репова, као што су рРНА, тРНА, некодирајућа РНА, мала РНА, прокариотска мРНА итд., Деградирана РНА и РНА са познатим секундарним структурама.

Шта је Олиго дТ?

Олиго дТ прајмер је део од 12-18 дезокситимина (дТ). Редослијед прајмера може се представити као 5'-д (ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ) -3. Користи се за производњу цДНА из мРНА која садржи поли (А) реп. У основи, делује као прајмер за реакцију катализирану реверзном транскриптазом. За време обрнуте транскрипције, олиго дТ прајмер исцељује полиаденилираним репом који се налази на 3 'крају већине еукариотских мРНА и започиње процес.

Слика 02: Обрнута транскрипција помоћу Олиго дТ прајмера

За разлику од случајног прајмера, олиго дТ прајмер није погодан за деградирану РНК или РНК којој недостају репови поли (А), укључујући прокариотску РНК и микроРНК.

Које су сличности између случајних примера и Олиго дТ?

• Насумични прајмер и олиго дТ прајмер су две врсте прајмера који се користе у обрнутој транскрипцији и стварању цДНА.
• Употреба случајног прајмера и олиго дТ прајмера заједно повећава осетљивост синтезе цДНА.
• Они су једноланчане кратке нуклеотидне секвенце.

Која је разлика између случајних примера и Олиго дТ?

Случајни прајмер је кратак олигонуклеотидни низ састављен од случајне секвенце. У међувремену, олиго дТ прајмер је кратак прамен, састављен од 12 до 18 деокситимидина. Дакле, ово је кључна разлика између случајних почетника и олиго дТ. Секвенца случајног прајмера је 5 '- д (НННННН) -3' Н = Г, А, Т или Ц. Док је секвенца олиго дТ прајмера 5'-д (ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ ТТТ) -3 ' . Стога ово можемо сматрати још једном разликом између случајних почетника и олиго дТ.

Штавише, случајни прајмери ​​не показују специфичност шаблона и они лече са било којом врстом РНК, док олиго дТ прајмери ​​показују специфичност за поли (А) репове еукариотске мРНА.

Подаци у наставку резимирају разлику између случајних почетника и олиго дТ.

Преглед - Рандом Примерс вс Олиго дТ

Насумични прајмер и олиго дТ прајмер су две врсте прајмера који се користе у синтези цДНА. Насумични прајмер се састоји од смеше олигонуклеотида који представљају све могуће хексамерне секвенце, док је олиго дТ прајмер једноланчани низ од 12 до 18 деокситимидина. Дакле, ово је кључна разлика између случајних почетника и олиго дТ. Поред тога, олиго дТ прајмери ​​су корисни за реверзну транскрипцију целокупне РНК са поли (А) репом, док су насумични прајмери ​​корисни за реверзну транскрипцију већине РНА врста, укључујући деградирану РНК, РНК којој недостају репови (А) и РНА који садрже секундарне структуре. Због тога, случајни прајмер не показује специфичност шаблона док олиго дТ пример показује специфичност према еукариотској мРНА која садржи поли (А) реп.

Референце:

1. „Постављање обрнуте транскрипције: Тхермо Фисхер Сциентифиц - УС“. Постављање обрнуте транскрипције | Тхермо Фисхер Сциентифиц - САД, доступан овде.

Љубазношћу слике:

1. „Примерс РевЦомп“ од Зепхирис - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 3.0) преко Цоммонс Викимедиа
2. "РТ ПЦР модел" од Локесхтхиммана - сопствени рад (ЦЦ БИ-СА 4.0) преко Цоммонс Викимедиа