Разлика између схРНА и сиРНА

схРНА вс сиРНА

Током процеса интерференције РНА (РНАи), експресија циљног гена се руши са великом специфичношћу и селективношћу. РНАи је природни процес и укључује мале интерферирајуће РНК (сиРНА) и кратку длаку РНА (схРНА) и би-функционалну схРНА. Тренутно се РНАи широко користи као алат за персонализовану терапију рака. Примена РНАи се у основи врши хемијски синтетизованом дволанчаном сиРНА и векторима заснованом схРНА молекулима. Иако ова два молекула имају сличне функционалне исходе, разликују се по својој структури; према томе, молекуларни механизми деловања, путеви РНА и ефекти тих двају молекула такође се разликују.

схРНА

схРНА је секвенца малог молекула РНК која прави уски преокрет длаке који се може користити за утишавање експресије циљног гена током РНАи. Експресија схРНА се постиже вектором, који може бити или вирус или бактерија или давањем плазмида. Синтетишу се у језгру ћелија и транспортују у цитоплазму ради даљег процеса. Ови молекули имају сличне путеве сазревања миРНА; стога је синтеза миРНА обезбедила основу за разумевање синтезе шРНА. Или РНА полимераза ИИ или ИИИ може транскрибирати схРНА преко промотора РНА полимеразе ИИ или ИИИ. Предност употребе схРНА је та што имају релативно ниску стопу деградације и промета. Недостатак је што му је потребан експресијски вектор, што може изазвати неке проблеме сигурности.

сиРНА

сиРНА су дволанчани РНА молекули сачињени у дужини од 20 до 25 парова база. Они се користе за супресију гена ушуткивањем било ког гена с комплементарном нуклеотидном секвенцом у РНАи путу. Пропадање гена трансфекцијом сиРНА често је неуспешно због пролазног ефекта; посебно у ћелијама које се брзо деле, а сузбијање не траје дуже. Да би се превазишао овај проблем, сиРНА се модификује увођењем кратке структуре длачица. Овај модификовани молекул тада познат као схРНА. схРНА би требало да преведе у сиРНА помоћу Дицер-а како би наставила своју нормалну функцију.

Која је разлика између схРНА и сиРНА?

• За разлику од сиРНА, схРНА има додатну структуру длаке. схРНА је модификована верзија сиРНА.

• схРНА захтева вектор експресије, док сиРНА не.

• схРНА се може користити за дугорочно оборење док се сиРНА може користити само за краткотрајни кноцкдовн гена.

• За разлику од супресије гена сиРНА, супресија схРНА је дуготрајна, и ако је убачена преко одговарајућег вирусног вектора, може произвести трајне ефекте пригушивања гена.

• Потребно је лепше претворити схРНА назад у молекулу сиРНА да би извршили њене нормалне функције.