Важно је имати опште знање о саставу и структури ДНК да би се разумела разлика између горње и ниже ДНК. ДНК је сачињена од полинуклеотидних ланаца. Нуклеотиди су градивни блокови који стварају полинуклеотидне ланце и сваки нуклеотид је начињен од три компоненте: шећера од пет угљеника, азотне базе и фосфатне групе. Фосфатна група и ОХ група су везане за 5 'угљени положај и 3' угљени положај молекула шећера у нуклеотиду, респективно. Нуклеотиди су спојени фосфодиестерским везама формираним између 5 'фосфатне групе једног нуклеотида и 3' ОХ групе суседног нуклеотида. Ако полинуклеотидни ланац има слободну 5 'фосфатну групу, он је додељен као 5' крај; ако има слободну 3 'ОХ групу, додељује се као 3' крај. Због тога, ланци ДНК обично имају 5 'и 3' крајеве према крајњем положају полинуклеотидних ланаца. ДНК такође постоји као дволанчани облик. Две нити су међусобно антипаралне. Према томе, ДНК има две нити које иду у правцу 5 'до 3' и 3 'до 5'. Узводно и низводно ДНК односи се на транскрипцију и синтезу ланца мРНА од 5 'до 3'. Ако се ДНК разматра према крају 5 ланца кодирања са места иницијације транскрипције, то је познато као узводна ДНК. Ако се ДНК разматра према 3 'крају из ланца кодирања са места иницијације транскрипције, позната је као ДНК низводно. Ово је кључна разлика између узводне и низводне ДНК.
САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је узводно ДНК
3. Шта је ДНК низводно
4. Упоредно упоређивање - узводно над низводно ДНК
5. Резиме
Ген је наследна структурна и функционална јединица која се налази на ДНК организма. Чува се са упутама за изградњу протеина. Ген има специфично подручје молекула ДНК. По потреби се преписује и претвара у протеин синтезом мРНА ланаца. Обично се кодирајући низ гена креће у правцу 5 'до 3'. Када се преписује, ствара се мРНА нит у истом правцу 5 'до 3'. Током транскрипције, 3 'до 5' антисенсе ланац служи као образац предлошка и покреће синтезу мРНА. У гену постоји место иницијације транскрипције. У односу на место иницијације транскрипције, ДНК регија према 5 'крају кодирајућег ланца позната је као узводна ДНК. Промотор гена се обично налази у предводној области ДНК. У еукариотским генима постоје ТАТА кутије, промоторни проксимални елементи и појачивачи у подручју узводно до гена. Узлазно подручје гена означено је негативним бројевима. ДНА изнад гена је од највећег значаја за транскрипцију.
Место иницирања транскрипције познато је као +1 тачка гена. ДНК регија од +1 тачке према 3 'крају кодирајућег ланца позната је као ДНК низводно. Другим речима, низводно од гена је од места иницијације транскрипције према 5 'крају ланца шаблоне. Због тога, низводна ДНК генске регије укључује транскрипцијску јединицу и друге секвенце, попут терминаторске секвенце. Промотор може утицати на низводну секвенцу гена. Следећи део гена се односи са позитивним бројевима. Дољеводна ДНК гена је стварна регија која даје протеински производ.
Слика 01: ДНК узводно и низводно
Упстреам вс довнстреам ДНА | |
Подручје ДНК према 5 'крају кодирајуће секвенце са места иницијације транскрипције познато је као узводна ДНК. | Подручје ДНК према 3 'крају кодирајућег ланца са места иницијације транскрипције познато је под називом ДНК низводно. |
Елементи | |
Промотери и појачивачи су смештени на узводној ДНК | Јединица за транскрипцију и секвенце терминатора налазе се у ДНК низводно. |
Нумерисање | |
Нуклеотиди у предводној регији наводе негативне бројеве | Нуклеотиди се наводе са позитивним бројевима. |
Функција | |
Овај регион садржи елементе неопходне за регулисање и покретање транскрипције | Овај регион садржи упутства за производњу протеина и прекид транскрипције |
Лако је препознати низ и низводно низ РНА. С обзиром на референтно место, регија према 5 'крају ланца РНК позната је као узводна РНА док је регија према крају 3' позната као РНА низводно. Међутим, у ДНК постоје две нити које се крећу у оба смера 5 'до 3' и 3 'до 5'. Стога је разлика између узводне и низводне ДНК компликована. Стога се разликује у односу на транскрипцију гена. Од места иницијације транскрипције према 5 крају чулног ланца, ДНК регија позната је као узводна ДНК док је од места иницијације транскрипције према 3 'крају осећајног ланца познато као ДНК низводно. То је разлика између узводне и низводне ДНК.
Референце:
1. Рхее, Ами Ц., Бењамин Х. Сомерлот, Неета Парими и Јонатха М. Готт. „Различите улоге за секвенце узводно од и даље од локација Пхисарумедитинга.“ РНА. Цолд Спринг Харбор Лаборатори Пресс, септембар 2009. Веб. 18 март 2017
Љубазношћу слике:
1. Барбоса, Цристина, Исабел Пеикеиро и Луиса Ромао. "Регулација експресије гена отвореним оквирима за читање и људским болестима." ПЛОС Генетика. Јавна библиотека науке, н.д. Веб. 18 март 2017.