Разлика између целог секвенце генома и секвенце ексоме

Тхе кључна разлика између секвенцирања целог генома и ексоме секвенцирања је то целог секвенцирања генома секвенце целог генома организма док секвенце секвенци егоме само ексоме или гена који кодирају протеине у организму.

Секвенцирање је техника која одређује тачан редослед нуклеотида у одређеној молекули ДНК. То само одражава тачан редослед четири базе; аденин (А), гванин (Г), цитозин (Ц) и тимин (Т) у ДНК фрагменту. Постоји неколико метода секвенцирања као што су Сангер секвенцирање, секвенција нове генерације итд. Надаље, било који комплетан геном организма (целог секвенцирања генома) или само гени који кодирају протеине у геному (екоме секвенционирање) могу бити подвргнути секвенцирању.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је секвенција целог генома
3. Шта је издвајање секвенце
4. Сличности између целог секвенце генома и секвенце ексоме
5. Упоредна успоредба - Секвенцирање читавог генома наспрам секвенце у табеларном облику
6. Резиме

Шта је цело секвенце генома?

Људски геном садржи готово три милијарде базних парова ДНК. Читаво секвенционирање генома је метода која секвенцира комплетни геном организма. Стога се у секвенцирању читавог генома разматра читава колекција молекула ДНК, укључујући дохотке, интроне, интергеничне просторе итд. Штавише, читаве секвенце геномске секвенце не само генома који се налази унутар језгре, већ и ДНК митохондрија..

Слика 01: Секвенцирање читавог генома

У припреми за ово секвенцирање, први корак је извлачење целог ДНК. Затим, екстрахована ДНК се подвргава поступку секвенцирања користећи одговарајући поступак секвенцирања. Анализом добијених секвенци, помоћу алата за биоинформатику, можемо сазнати ретке болести, рак, заразне болести итд..

Шта је издвајање секвенце?

Екоме је део генома који садржи око 1,5% генома, а збирка је егзона. Егзони су низови који се преписују у мРНА, а затим у коначни протеински производ. Дакле, секвенцирање екоме секвенцира читаве низове кодирања протеина у геному. Ексцесно секвенцирање открива генетске поремећаје јер већина генетских поремећаја настаје због мутација гена који кодира протеин. Стога дијагностички процеси генетских поремећаја често користе секвенцу егза као методу за дијагнозу болести. Такође, када се упореди са читавом апликацијом за секвенцирање генома за генетичко тестирање, секвенца екоме захтева мање времена за коришћење и јефтинија је.

Слика 02: Редовање ексомената

Код екоме секвенцирања, прво је потребно одабрати само секвенце које кодирају протеине из укупне ДНК. Имајте на уму да људи имају око 180000 секвенце кодирања протеина. Затим се егзом секвенционира методом секвенцирања високе пропусности.

Које су сличности између целог секвенце генома и секвенце ексоме?

• Секвенцирање читавог генома и ексоме секвенција две су апликације секвенце.
• Обе методе су корисне за одређивање тачног редоследа нуклеотидне секвенце у обе методе.
• Такође, биоинформатика помаже у обе технике за анализу података.

Која је разлика између целог секвенце генома и ексоме секвенце?

Секвенце целог генома секвенцирају читаву ДНК генома организма, док секвенце ексоме секвенције представљају само протеинске кодирајуће секвенце генома. Стога је ово суштинска разлика између секвенцирања целог генома и ексоме секвенцирања. Такође, иако се обе методе широко користе да се утврди тачан редослед нуклеотидних секвенци, целокупно секвенцирање генома је скупо и дуготрајно у односу на секвенцу екоме.

Подаци у наставку приказују разлику између секвенцирања читавог генома и ексоме секвенцирања.

Резиме - Секвенцирање читавог генома наспрам Секвенцирања егомета

Секвенцирање открива тачан редослед база у фрагменту ДНК и то може бити било секвенционирање целог генома или ексоме секвенција. Овде секвенце читавог генома представљају комплетан геном организма док секвенце екоме секвенцирају само секвенце које кодирају протеине у геному. Узимајући у обзир њихову примену, целокупно секвенцирање генома корисно је за анализу генетских аберација као што су варијације појединачних нуклеотида, брисања, убацивања итд. У целом геному, док је секвенција егза корисна у откривању генетских болести. Стога је ово разлика између секвенцирања целог генома и ексоме секвенцирања.

Референце:

1. „Секционирање са целим геномом против секвенцирања са целим егзом насупрот циљаним панелима за секвенцирање.“ Хеалио, СЛАЦК Инцорпоратед. Доступно овде  
2. „Шта су цело секвенцирање егзома и секвенционирање целог генома? - Почетна страница Генетицс - НИХ. " Америчка национална медицинска библиотека, Национални институти за здравље. Доступно овде  

Љубазношћу слике:

1. „Секвенцирање пушака са целим геномом наспрам хијерархијског секвенцирања сачмарица“ Би Цомминс, Ј., Тофт, Ц., Фарес, М. А. - „Методе рачунске биологије и њихова примена у упоредној геномики ендоцелуларних симбиотских бактерија инсеката.“ (ЦЦ БИ-СА 2.5) виа Цоммонс Викимедиа  
2. "Екоме Секуистинг Воркфлов 1а" написао СарахКусала - Властити рад, (ЦЦ БИ 3.0) преко Цоммонс Викимедиа