Агаросе вс Полиакриламид
Постоје различите разлике које се односе на агарозу и полиакриламид, укључујући њихову физичку структуру, токсичност и методе изливања, као и њихову цену. Корисно је знати ове разлике, као и њихове сличности, ако се бавите било којим од ових типова гелова.
Једна од главних разлика између ова два гела је та што се агароза излива хоризонтално, док се полиакриламид сипа вертикално. Далеко је лакше сипати агарозу на овај хоризонтални начин. Агароза се може загрејати како би се олакшао процес изливања, мада је не треба загревати до толике мере да се агароза заврши топљењем. Такође се може одлучити да ли ће се за усипање агарозе користити уске или широке траке. Може се сипати помоћу ове методе жљебљења, и то је једна од његових предности. Приликом улијевања треба бити веома опрезан, јер је агароза врло осјетљива и лако се може сломити.
Са друге стране, као што је већ поменуто, полиакриламид се улива вертикално. Полиакриламиду су потребне стаклене плоче како би помогле у овом процесу, јер је његова структура врло танка, а ова додатна подршка је неопходна. За разлику од агарозе, полиакриламид се не може поново загревати, а затим сипати.
Агароза се састоји од многих молекула, док се полиакриламид обично састоји од само једног великог молекула. Молекули агарозе су повезани интермолекуларним силама, а молекули су састављени од ДНК. Постоје велики и мали молекули и уопште се већи молекули лакше одвајају од мањих. Молекул полиакриламида састоји се од ДНК или протеина. Празнине између гела полиакриламида су мање него оне између гелова агарозе, што је друга разлика између ове две супстанце. Тамо где је величина трака једнака у агарози, постоје различите величине траке у полиакриламиду. Ако је молекул полиакриламида изложен ваздуху, неће се равномерно очврснути, јер ваздух убрзава процес полимеризације.
Што се тиче токсичности, агароза се сматра нетоксичном супстанцом. Иако се полиакриламид сматра истим, његов прах се сматра токсичним, па је мудро чак и геловима руковати заштитним мерама..
Полиакриламид се користи за секвенцирање гелова и протеинских гелова. Његове предности су што има лака својства бојења и може се сушити да би се створио гел. Купује се претходно наливен и јефтинији је од агарозе, око 5 до 7 долара по гелу. (Агаросе је око 1 долара по граму). Особи се препоручује да има довољно искуства пре куповине било ког од ова два гела, јер често, потребан број узорака и потребна концентрација гела, морају бити познати пре било које куповине.
Резиме:
1.Агароза се сипа водоравно, док се полиакриламид излива вертикално.
2.Агароза је скупља од полиакриламида.
3.Агароза се састоји од многих молекула, док се полиакриламид састоји од само једног великог молекула.
4.Налик полиакриламид, агароза се може поново загревати.
5.Агароза се сматра нетоксичном супстанцом у свим њеним облицима, док је прах полиакриламида утврђен да је токсичан.