СДС ПАГЕ вс Гел Елецтропхоресис
Електрофореза се може користити за утврђивање масе објекта обично за протеин и деоксирибонуклеинску киселину (ДНК). Конац ДНК, када се уведе у хемикалије, може убрзати или успорити процес информисања. ДНК маркери познате масе користе се за приближавање величине објеката који путују након завршетка електрофорезе. Електрофореза је највероватније најчешће коришћено средство за молекуларне биологе и биохемичаре.
Постоје две врсте електрофорезе које се обично користе у овом процесу. То су натријум додецил сулфат полиакриламид гел електрофореза (СДС-ПАГЕ) и електрофореза нативног гела.
СДС-ПАГЕ је неселективна метода електрофорезе гела која се користи у областима као што су: биохемија, форензика, биологија и генетика за одвајање протеина од њихове електрофоретске покретљивости. СДС је анионско површински активно средство које се може користити за помоћ у лизирању ћелија током екстракције ДНК и за одвајање протеина у СДС-ПАГЕ. Током електрофорезе, смеша протеина се прво укапава у раствор СДС. Затим се супстанца звана Меркаптоеетанол наноси за уклањање дисулфидних веза како би протеин био линеаран. Потом се започиње електрофореза. Резултати би дали два остатка молекула, од којих је један СДС-ПАГЕ.
Одсуство СДС-ПАГЕ није проблем јер се електрофореза гела и даље може урадити само што протеини не изгубе сву своју секундарну и терцијарну структуру и не отварају се у обично праве шипке.
У међувремену, нативна гел електрофореза користи гел као антиконвективни медијум. Обично се користи за одвајање биолошких макромолекула попут ДНК, рибонуклеинске киселине (РНА) и протеина. Такође се може користити за одвајање наночестица.
Постоје два главна гела која се користе у природној гел електрофорези, и то:
Агарозни гел који се користи за веће молекуле. Овај гел не идентификује мале разлике између две молекуларне врпце. Такође се користи искључиво за одвајање ДНК. Визуализација гела агарозе врши се мешавином етидијевог бромида.
Полиакриламидни гел који се користи за мање молекуле. Овај гел идентификује разлике између молекуларних опсега. Поред ДНК, може одвојити и протеине.
Резиме:
1.СДС-ПАГЕ је неселективна метода електрофорезе гела која се користи у областима као што су: биохемија, форензика, биологија и генетика за одвајање протеина од њихове електрофоретске покретљивости, док се гел електрофореза обично користи за одвајање биолошких макромолекула попут ДНК, рибонуклеинска киселина (РНА) и протеин. Такође се може користити за одвајање наночестица.
2.Нативе гел електрофореза има две врсте, и то: агарозни гел и полиакриламидни гел.