Разлика између СДС странице и Нативе Паге

Кључна разлика - СДС Страница против Нативе Страна
 

СДС и матична страница су две врсте електрофорезе полиакриламидног гела које се користе у Молекуларној биологији. Тхе кључна разлика између СДС странице и Нативе Паге је врста полиакриламидног гела. У СДС Паге се користи денатурирајући гел, молекули су одвојени на основу њихове молекулске тежине. Супротно томе, у Нативе Паге се користе ненатурирајући гелови. Стога се молекули одвајају на основу њихове величине, набоја и облика.

Полиакриламид гел електрофореза (Страница) користи гел који је произведен полимеризацијом мономера акриламида метилен бизакриламидом. Полиакриламид је чвршћи и топлотније стабилан од агарозе. Полиакриламидни гели имају мању величину пора који омогућава ефикасно одвајање протеина. Постоје две главне врсте подешавања странице, и то СДС стране и Нативе Паге. Страница СДС или Натријум-додецил сулфат полиакриламид гел електрофореза одваја протеине на основу њихове молекуларне тежине. Гена за денатурацију користе се у СДС страници. Нативе Паге користи гелове који не денатурирају и одваја протеине на основу њихове величине, набоја и облика (3Д конформација).

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је страница СДС
3. Шта је изворна страница
4. Сличности између Странице СДС-а и Нативе Паге-а
5. Упоредно упоређивање - Странице СДС-а против матичне странице у табеларном облику
6. Резиме

Шта је страница СДС?

СДС Паге је најчешћа електрофоретска техника која се користи за одвајање протеина на основу њихове молекуларне тежине. Гел је направљен додавањем СДС (Натријум додецил сулфата), који је детерџент. СДС протезира протеине у мономере. СДС је анионски детерџент. Због тога додаје нето негативан набој протеинима у широком опсегу пХ. Када се нето негативни набој преноси на молекуле протеина, због варијације набоја, сложене структуре се разграђују. Због негативног набоја, протеини привлаче позитиван крај. Тако молекули са нижом молекуларном тежином брже путују на гел матриксу и могу се посматрати близу аноде, док се протеини веће молекуларне тежине посматрају ближе јажици.

Слика 01: Страница СДС

Везивање СДС-а на полипептидни ланац пропорционално је релативној молекулској маси. Због тога се молекулска маса такође може одредити помоћу СДС Паге. Бојење СДС гелова на страници врши се бромофенол плавим бојењем. Примене СДС странице у већој мери се крећу тамо где се може користити за процену релативне молекулске масе и за одређивање релативног броја протеина у протеинској смеши. СДС Страница се такође може користити за одређивање расподјеле протеина у смјеси протеина. СДС Страница се такође примењује за пречишћавање и процену протеина. Користи се као прелиминарни поступак за западну блотирање и хибридизацију, који се са друге стране користи за мапирање и идентификацију протеина.

Шта је Нативе Паге?

Електрофореза нативног полиакриламидног гела (Нативе Паге) користи гел који не денатурише. Због тога се СДС или било које друго средство за денатурацију не додаје у гел матрицу. У Нативе Паге-у, одвајање протеина се заснива на набоју и величини протеина. Због тога, покретљивост протеина зависи од набоја и величине протеина.

Наелектрисање протеина зависи од бочних ланаца аминокиселина. Ако су бочни ланци негативно набијени, протеин ће добити укупно негативно наелектрисање и обрнуто. Протеини задржавају 3Д конформацију због пресавијања које се догађа. Савијање је резултат неколико врста веза у протеинима као што су дисулфидне везе, хидрофобне интеракције и водоничне везе. Стога, ако се матични Паге носи на неутралном пХ, протеини ће се одвојити у складу са молекуларним обликом протеина. Стога се „Нативе Паге“ може користити као осетљива техника за откривање промене набоја или конформације протеина.

Главна предност изворне странице је што се протеин коришћен за анализу странице може вратити у првобитно стање након анализе странице, јер се протеин не поремети током процеса. Нативе Паге је релативно висока техника пропусности, а стабилност протеина је повећана.

Слика 02: Изворна страница

По завршетку гела, Нативе Паге гел се може видети бојењем бромофенолом плавим или било којим другим погодним реагенсом за бојење. Примена Нативе Паге укључује раздвајање киселих протеина, укључујући гликопротеине, као што су хумани рекомбинантни еритропоетин, или идентификацију протеина присутних у говеђем серумском албумину (БСА).

Које су сличности између Странице СДС-а и Нативе Паге-а?

• Оба система СДС Паге и Нативе Паге користе полиакриламидни гел као матрицу гела.
• Обе се користе за одвајање и идентификацију протеина.
• Обоје користе електрофоретску покретљивост за раздвајање једињења.
• Обоје се може обавити вертикално или хоризонтално (углавном се врши као вертикално подешавање странице јер је дужина извођења већа).
• Апарат за електрофорезу, укључујући резервоар за гел, чешљеве, напајање је потребан за рад обе технике.
• Визуализација гела се може обавити методама обојења у обе технике.

Која је разлика између СДС странице и Нативе Паге?

СДС Страница вс Нативе Паге
СДС Паге или Натријум-додецил сулфат Паге раздваја протеине на основу њихове молекуларне тежине и користи денатурирајући гел.	Нативе Паге користи гелове који не денатурирају и одваја протеине на основу њихове величине, набоја и облика (3Д конформација).
Тип гела
На СДС-страници се користи гел за денатурацију.	На матичној се страници користи ненатрпавајући гел.
Присуство СДС-а
СДС је присутан као детерџент за додавање негативног набоја на узорку на СДС страници.	СДС не постоји на матичној страници.
Основа одвајања
Одвајање протеина зависи од молекулске тежине протеина у СДС страници.	Одвајање зависи од величине и облика протеинске молекуле на матичној страници.
Стабилност протеина
Стабилност протеина је на СДС страници ниска.	Стабилност протеина је велика на почетној страници.
Опоравак оригиналног протеина
Није могуће пошто је денатурирано на страници СДС-а.	Могуће на матичној страници.

Резиме - СДС Страница вс Нативе Страна

СДС Паге и Нативе Паге су две врсте електрофорезе гела полиакриламидног гела који се користе за одвајање протеина. СДС Страница се третира детерџентом који се назива СДС. СДС даје укупни негативни набој протеину, што онда резултира денатурацијом протеина. Због тога се протеини одвајају на основу њихове молекуларне тежине. Супротно томе, техника Нативе Паге не користи ниједно средство за денатурацију. Тако су протеини или одвојени на основу њихове величине или облика. Ово је разлика између СДС странице и матичне странице.

Референце:

1. "Принцип и метода електрофорезе гела из полиакриламида (СДС-ПАГЕ)." Принцип и метода електрофорезе полиакриламидног гела (СДС-ПАГЕ) | МБЛ Лифе Сиенце -АСИА-. Доступно овде
2. "Нативе Гелови." Аллианце Протеин Лабораториес | Услуге биофизичке карактеристике. Доступно овде  

Љубазношћу слике:

1.'СДС-ПАГЕ Елецтропхоресис'Би Бенсаццоунт ат Енглисх Википедиа, (ЦЦ БИ 3.0) виа Цоммонс Викимедиа  
2.'Уставите узорак у електрофорезу са полиакриламидним гелом "Блаз Немец из Љубљане, Словенија (ЦЦ БИ-СА 2.0) преко Цоммонс Викимедиа