Разлика између АФЛП и РФЛП

Кључна разлика - АФЛП вс РФЛП
 

ДНК студије имају огроман значај у разумевању и утврђивању филогенетских односа, дијагностицирању генетских болести и мапирању генома организма. Неколико техника повезаних са ДНК анализом такође се користи за идентификацију одређеног гена или ДНК секвенце у групи непознатих ДНК. Познати су као молекуларни маркери. Полиморфизам дужине појачаног фрагмента (АФЛП) и Полиморфизам дужине фрагмента рестрикције (РФЛП) су два таква молекуларна маркера (методе) развијена у молекуларној биологији да би се откриле генетске варијације између организама. Обе методе су подједнако важне и имају предности и недостатке. Кључна разлика између АФЛП и РФЛП је та АФЛП укључује селективно ПЦР амплификацију дигестиране ДНК док РФЛП не укључује селективно ПЦР амплификацију фрагмената ДНА..

САДРЖАЈ
1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је АФЛП
3. Шта је РФЛП
4. Упоредна упоредба - АФЛП вс РФЛП
5. Резиме

Шта је АФЛП?

АФЛП (полиморфизам дужине појачаног фрагмента) је важно средство у молекуларној биологији и широко се користи у анализи генетичких варијација. АФЛП се заснива на специфичном ПЦР амплификацији фрагментиране геномске ДНК и детекцији полиморфизма ауторадиографима помоћу гел електрофорезе. АФЛП увелико доприноси утврђивању генетских разлика у сојевима или сродним врстама различитих краљевстава, укључујући биљке, животиње, бактерије и гљивице. АФЛП се може извести са малим количинама непознатих ДНК узорака. Не захтева претходно познавање секвенце и пројектовање сонди.

Кораци АФЛП-а

1. Изолација ДНК
2. Дигестија ДНК са рестрикцијским ендонуклезама
3. Лигација ограничених фрагмената ДНК адаптерима
4. Селективно појачавање фрагмената са специфичним рестрикцијским местима
5. Раздвајање ПЦР производа гел-електрофорезом
6. Визуализација гел матрице ауторадиографом

АФЛП је осетљивија и репродуктивнија метода која се може користити у ДНК профилирању неколико својти, укључујући гљивице, бактерије, биљке и животиње без претходног сазнања о ДНК секвенци. Помаже у препознавању малих разлика међу појединцима у популацији због изразито осетљиве природе. АФЛП је такође важан у мапирању генома, форензичким студијама, родитељском тестирању, генотипизацији итд.

Слика 01: АФЛП

Шта је РФЛП?

Полиморфизми дужине фракције рестрикције (РФЛП) је техника која се користи за откривање генетских варијација у хомологним ДНК секвенцама. То је прва метода развијена за ДНК профилисање. Организми имају јединствене ДНК отиске прстију или ДНК профиле. РФЛП служи као важно средство за анализу варијације између ДНК профила интраспецифичних или уско повезаних организама, јер хомологне секвенце имају различита места (локације) рестрикције јединствена за одређени организам. Када се хомологна ДНК дигестира са специфичним рестрикцијским ендонуклеазама, то ће резултирати различитим профилима ДНК који су јединствени за сваког појединца. Стога је основно у овој методи откривање генетске варијације међу организмима ограничавањем хомологне ДНК специфичним рестрикцијским ензимима и анализа полиморфизма дужине фрагмента путем гел електрофорезе и брисања. Обрасци мрље јединствени су за сваки организам и карактеришу специфичне генотипове.

Кораци РФЛП-а

1. Изолација довољне количине ДНК из узорака
2. Фрагментација ДНК узорака са специфичним рестрикцијским ендонуклеазама улази у кратку секвенцу
3. Одвајање добијених фрагмената различите дужине електрофорезом агарозног гела.
4. Преношење гел профила у мембрану са јужњачким упијањем

5. Хибридизација мембране са обележеним сондама и анализа полиморфизма дужине фрагмента у сваком профилу

РФЛП је веома важна техника откривања наслеђивања болести и проналажења ризика од појаве болести међу члановима породице. РФЛП се такође често користи у мапирању генома, идентификовању криминалаца у форензичкој медицини, тестирању очинства, итд. РФЛП такође има неколико ограничења. РФЛП захтева претходно познавање података о секвенци да би се конструисале сонде за хибридизацију. Такође је потребна изолација довољне количине ДНК из узорка за анализу, што је тешко у форензичким студијама.

Слика 01: РРФЛП мапирање

Која је разлика између АФЛП и РФЛП?

АЛФП вс РФЛП
АФЛП укључује селективно ПЦР умножавање пробављене ДНК.	РФЛП не укључује ПЦР осим ако није ПЦР-РФЛП.
Знање у секвенци
Претходно знање о секвенци није потребно.	За дизајниране РФЛП сонде потребно је претходно знање о секвенци.
Поузданост
Ово је поузданије.	Ово је мање поуздано у поређењу са АФЛП-ом.
Ефикасност у откривању полиморфизма
Ово има већу ефикасност у откривању полиморфизма од РФЛП-а.	Ово је мање ефикасно у поређењу са АФЛП-ом.
Трошак
Ово је мало скупље у поређењу са РФЛП-ом.	Ово је јефтиније у поређењу са АФЛП-ом.
Апликације
АФЛП-ови су примењени за мапирање генома, ДНК отиске прстију, студије генетске разноликости, тестирање очинства и форензика	РФЛП анализа је важно средство у мапирању генома, локализацији гена за генетске поремећаје, одређивању ризика од болести и тестирању очинства.

Преглед - АФЛП вс РФЛП

АФЛП и РФЛП су две технике које се користе као генетски маркери за процену разноликости и процену генетских односа у молекуларној биологији. АФЛП служи као ефикасна и осетљива метода за откривање генетског полиморфизма између организама него РФЛП. Међутим, иако обе ове методе имају различиту ефикасност у детекцији генетских варијација, оне се и даље користе за одузимање отиска ДНК и дијагнозу болести.

Референце:
'1. Гарциа, Антонио А. Ф., Луциана Л. Бенцхимол, Антониа М. М. Барбоса, Исаиас О. Гералди, Соуза Јр. Цлаудио Л. и Анете П. Де Соуза. „Поређење маркера РАПД, РФЛП, АФЛП и ССР за студије разноликости у линијама с тропским кукурузом.“ Генетика и молекуларна биологија. Социедаде Брасилеира де Генетица, 2004. Веб. 19 мар. 2017
2. „Полиморфизам дужине ограничења (РФЛП).“ Национални центар за информације о биотехнологији. Америчка национална медицинска библиотека, н.д. Веб. 19 мар. 2017
3. Масига Д. К. и Турнер Ц. М. (2004). „Појачана (рестриктивна) анализа дужине полиморфизма (АФЛП) у дужини фрагмента“. Методе Мол Биол: 270: 173-86. НЦБИ. Веб. 19 мар. 2017

Љубазношћу слике:
1. "АЛФП" Барбаросса са холандске Википедије - Пребачен са нл.википедиа у Цоммонс. (Публиц Домаин) преко Цоммонс Викимедиа
2. „РФЛП пресликавање“ од стране Ретама - Властити рад (ГФДЛ) преко Цоммонс Викимедиа