Разлика између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела

Кључна разлика - хоризонтална вс вертикална електрофореза гела
 

Гел електрофореза је лабораторијска техника која се користи у генетици да би се одвојиле смеше које садрже ДНК, РНК и друге протеине према њиховом одговарајућем набоју и молекуларној величини. ДНК, РНА или протеини које треба одвојити овом методом проводе се кроз гел који садржи мале поре. Молекули се кроз гел покрећу електричним пољем. Молекули пролазе кроз поре гела, а брзина кретања је обрнуто пропорционална њиховим дужинама. Због тога ће се молекули мање молекуларне величине кретати брже од молекула веће молекуларне тежине. Електрично поље настаје разликом наелектрисања на два краја гела. Један крај садржи позитивно наелектрисање, а други крај негативан набој. Пошто су молекули ДНК и РНК негативно наелектрисане, оне ће бити привучене према позитивно наелектрисаном крају гела. Гел електрофореза може бити две различите методе: хоризонтална гел електрофореза и вертикална гел електрофореза. У хоризонталној гел електрофорези гел је присутан у водоравној оријентацији и потопљен је у непрекидни пуфер који ради унутар самог кутија гела. Код вертикалне гел електрофорезе пуферски систем је оријентисан вертикално и непрекидно је са две коморе које су присутне на врху и на дну са катодом и анодом, односно. Ово је кључна разлика између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела.

САДРЖАЈ

1. Преглед и кључне разлике
2. Шта је хоризонтална гел електрофореза
3. Шта је вертикална гел електрофореза
4. Сличности између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела
5. Упоредна упоредба - хоризонтална вс вертикална електрофореза гела у табеларном облику
6. Резиме

Шта је хоризонтална гел електрофореза?

Хоризонтална електрофореза гела користи основну теорију за одвајање молекула ДНК, РНК или протеина у складу са њиховом молекуларном величином и набојем. У овој техници, гел је присутан у водоравној оријентацији и потопљен је у пуфер који је континуиран. Агарозни гел се користи за одвајање кутије гела у два дела. Један крај кутије са гелом садржи аноду, док други крај садржи катоду. Када се примењује струја, пуфер коришћен у овој техници омогућава креирање градијента набоја. Када се наелектрисање нанесе, гел се загрева. Пуфер такође делује као расхладна течност, која одржава температуру на оптималним нивоима. Рециркулација текућег пуфера спречава стварање градијента пХ. Дисконтинуирани пуферски систем се не може користити у хоризонталној гел електрофорези јер се два одељка гел система повезују са текућим пуфером. Акриламид се користи током гел електрофорезе за одвајање протеинских смеша.

Слика 01: Електрофореза хоризонталне гела

У хоризонталној гел електрофорези акриламид се не може користити јер је гел кутија изложена кисеонику. Због присуства кисеоника, полимеризација акриламида је инхибирана, што омета стварање гела. Хоризонтална гел електрофореза је метода без напора која се користи у одвајању ДНК и РНК.

Шта је електрофореза вертикалним гелом?

Техника вертикалне гел електрофорезе функционише у складу са примарном теоријом гел електрофорезе, али се сматра да је она сложенија од методе хоризонталне гел електрофорезе. Ова техника користи дисконтинуирани пуфер. Катода се налази у горњој комори, а анода се налази у доњој комори. Електроде присутне у сваком одељку дају потребно електрично поље. Танак слој гела сипа се између две монтиране стаклене плоче. Стога је горњи део гела потопљен у горњој комори, а доњи део гела је потопљен у комори на дну. Једном када се примени струја, мали део пуфера прелази у доњу комору из горње коморе кроз гел. Струја примењена у овој техници је минутних јединица.

Слика 02: Вертикална гел електрофореза

Код вертикалне електрофорезе гела пуфер тече само кроз гел. Ово омогућава прецизну контролу градијента напона током фазе раздвајања. Акриламидни гел се може користити јер одељци нису изложени атмосферском кисеонику. Због мање величине пора акриламидног гела, прецизно одвајање може се постићи с већом резолуцијом.

Које су сличности између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела?

• Оба система функционишу у складу са основном теоријом електрофорезе гела.
• Анода и катода користе се за обезбеђивање потребног електричног поља у оба система.

Која је разлика између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела?

Хоризонтална вс вертикална електрофореза гела
Хоризонтална електрофореза гела је техника електрофорезе гела у којој је гел присутан у хоризонталној оријентацији.	Вертикална гел електрофореза је техника електрофорезе гела у којој је гел оријентисан вертикално.
Буффер
Хоризонтална електрофореза гела састоји се од континуираног пуфера.	Пуфер у текућем стању се прекида у вертикалној гел електрофорези.
Употреба акриламида
Акриламид се не може користити за хоризонталну гел електрофорезу јер је гел кутија изложена атмосферском кисеонику.	Пошто гел није изложен атмосферском кисеонику због две одвојене коморе, акриламид се може користити за вертикалну гел електрофорезу.
Функција
Хоризонтална гел електрофореза се чешће користи за одвајање смеша ДНК и РНА, али не и протеина.	Вертикална гел електрофореза користи се за одвајање мешавина протеина.

Преглед - Хоризонтална вс вертикална електрофореза гела

Гел електрофореза је лабораторијска техника која се широко користи у одвајању смеша које садрже молекуле ДНК, РНК и протеина. Постоје две методе гел електрофорезе: хоризонтална и вертикална гел електрофореза. Код хоризонталне гел електрофорезе, пуфер који ради је континуиран, док је у вертикалној гел електрофорези прекид. Ово је разлика између хоризонталне и вертикалне гел електрофорезе. Оба система функционишу по заједничком принципу гел електрофорезе.

Преузмите ПДФ верзију хоризонталне вс вертикалне гел електрофорезе

Можете преузети ПДФ верзију овог чланка и користити је за оффлине употребу према напомени. Молимо преузмите ПДФ верзију овде. Разлика између хоризонталне и вертикалне електрофорезе гела.

Референце:

1.Варрен, Цхад М. и др. "Вертикална агароза гел електрофореза и електроблокирање протеина високе молекулске тежине." Електрофореза, вол. 24, бр. 11, 2003, стр. 1695-1702., Дои: 10.1002 / елпс.200305392.
2. "Хоризонтални и вертикални систем гела - Хоризонтални систем гела." Национална дијагностика, доступна овде. Приступљено 28. августа 2017.

Љубазношћу слике:

1. "Апарат за гел електрофорезу" Аутор: Јеффреи М. Виноцур - Властити рад (ЦЦ БИ 2.5) преко Цоммонс Викимедиа
2. "Електрофореза полиакриламидног гела у протеинима" Јеан-Етиенне Минх-Дуи Поирриер из Брукеллеса, Белгија - Протеини у 1Д гел електрофорези (ЦЦ БИ-СА 2.0) преко Цоммонс Викимедиа